Určení pozice globulární domény histonu H5 v nativním nucleosomu pomocí kryo-elektronové mikroskopie a rekonstrukce isolované částice.

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Standardní projekty

Veřejná soutěž

Standardní projekty 8 (SGA02005GA-ST)

Hlavní účastníci

—

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

304/05/2168

Název projektu anglicky

Determination of the histone H5 globular domain position within the native nucleosome using cryo-electron microscopy and single particle reconstruction.

Anotace anglicky

The first level of the chromatin compaction, the formation of the 30 nm chromatin fibre, still remains partly unresolved, especially the process of its transition from a relaxed zig-zag at low ionic conditions into q compact fibre at physiological concentrations. It is evident that the presence of the linker histone is necessary for organised fibre folding. However, its position within the nucleosome still represent not fully resolved problem, its exact position relative to the histone octamere and entering/exiting DNA is determinant for the topological properties of both the individual nucleosome and the chromatin fibre. This project aims to determine the position of the globular domain of linker histone H5 on native nucleosome using cryo-electron microscopy and single particle reconstruction. The expected results shall resolve a long lasting ambiguity in the determination of the linker histone position, persistent in the literatuoe over the last decade. Revealing the structural

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

EA - Morfologické obory a cytologie

CEP - vedlejší obor

—

CEP - další vedlejší obor

—

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10601 - Cell biology<br>10602 - Biology (theoretical, mathematical, thermal, cryobiology, biological rhythm), Evolutionary biology

Hodnocení poskytovatelem

U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Původně stanoveného cíle, tedy stanovení polohy globulární domény spojovacího histonu H5 v nukleozomu, se dosáhnout nepodařilo a to zejména z důvodů uvedených v části 2 části ZC. Tyto důvody vedly k modifikaci původního plánu a k hledání alternativních m

Zahájení řešení

1. 1. 2005

Ukončení řešení

31. 12. 2007

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

2. 5. 2007

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP08-GA0-GA-U/04:3

Datum dodání záznamu

16. 12. 2008

Celkové uznané náklady

2 661 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

2 639 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

32 tis. Kč