Funkční genomika chmelu (H. lupulus L.) s ohledem na geny kodeterminující produkci lupulinu
Cíle projektu
Projekt zahrnuje strukturní a funkční analýzu genomové organizace homologů chalkonsytázových (chs) genů, které byly v současné době identifikovány jako determinanty biosyntézy hořkých kyselin produkovaných ve žláznatých trichomech hlávek chmelu, cennýchpro výrobu piva a dále prenylovaných flavonoidů, jež jsou studovány pro své potenciální protirakovinové účinky. Jak vyplývá z naší předešlé práce, chmelové homology chs genů tvoří genové rodiny a jejich tkáňově specifická exprese je přísně regulována. Jeproto důležité identifikovat regulační faktory odpovědné za významné rozdíly mezi jednotlivými kultivary chmelu v obsahu těchto sekundárních metabolitů. S cílem přispět k řešení této problematiky projekt zahrnuje konstrukce genomové a cDNA knihovenchmelu,u kterých bude proveden jednak "screening" homologů chs genů, jejich klastrů i promotorových regulačních sekvencí a jednak sekvencí příbuzných R2R3 MYB genům, z nichž některé jsou známy jako regulační faktory homologických biosyntetických drah
Klíčová slova
Veřejná podpora
Poskytovatel
Grantová agentura České republiky
Program
Standardní projekty
Veřejná soutěž
Standardní projekty 2 (SGA02003GA-ST)
Hlavní účastníci
Biologické centrum AV ČR, v. v. i.
Druh soutěže
VS - Veřejná soutěž
Číslo smlouvy
—
Alternativní jazyk
Název projektu anglicky
Functional genomics of hop (H. lupulus L.) with respect to genes co-determining lupulin production
Anotace anglicky
It is proposed to analyse structural and functional aspects of genomic organization of chalcone synthase (chs) homologues, which have been found recently to be involved in biosynthesis of bitter acids valuable for bitterness of beer and prenylatedflavonoids, potential anti-cancerogenic components of lupulin. Hop chs homologues form specific oligofamilies and as follows from our previous work, their tissue-specific expression is strongly regulated. Therefore, it is important to identify regulatoryfactorsresponsible for significant differences among hop cultivars in the content of these secondary metabolites. To contribute to solution of this problem, we aim to construct hop genomic and cDNA (glandular tissue-specific) libraries, which will bescreened for chs-related genes, gene clusters including upstream regulatory regions and specific R2R3 MYB-related sequences, known for their potential to regulate homologous phenylpropanoid biosynthesis pathways. Functional analysis of recombinant
Vědní obory
Kategorie VaV
ZV - Základní výzkum
CEP - hlavní obor
EB - Genetika a molekulární biologie
CEP - vedlejší obor
GE - Šlechtění rostlin
CEP - další vedlejší obor
—
OECD FORD - odpovídající obory
(dle převodníku)10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)
10605 - Developmental biology
10608 - Biochemistry and molecular biology
10609 - Biochemical research methods
30101 - Human genetics
40105 - Horticulture, viticulture
40106 - Agronomy, plant breeding and plant protection; (Agricultural biotechnology to be 4.4)
Hodnocení dokončeného projektu
Hodnocení poskytovatelem
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Zhodnocení výsledků projektu
V projektu byly zkonstruovány genomové (l-GEM-11) a cDNA (Uni-ZAP-XR) knihovny českého chmelu a proveden jejich skríning Byly získány a charakterizovány nové sekvence a geny chmelu, které se projevují v chmelových hlávkách. Zejména byla sekvenčně zmapov
Termíny řešení
Zahájení řešení
1. 1. 2003
Ukončení řešení
1. 1. 2005
Poslední stav řešení
U - Ukončený projekt
Poslední uvolnění podpory
—
Dodání dat do CEP
Důvěrnost údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Systémové označení dodávky dat
CEP06-GA0-GA-U/07:6
Datum dodání záznamu
15. 1. 2009
Finance
Celkové uznané náklady
5 517 tis. Kč
Výše podpory ze státního rozpočtu
2 944 tis. Kč
Ostatní veřejné zdroje financování
0 tis. Kč
Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.
2 573 tis. Kč
Základní informace
Uznané náklady
5 517 tis. Kč
Statní podpora
2 944 tis. Kč
53%
Poskytovatel
Grantová agentura České republiky
CEP
EB - Genetika a molekulární biologie
Doba řešení
01. 01. 2003 - 01. 01. 2005