Dynamika mitochondriální DNA a polymorfismus transkripčních profilů u Silene vulgaris

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Standardní projekty

Veřejná soutěž

Standardní projekty 12 (SGA02009GA-ST)

Hlavní účastníci

—

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

521-09-0261

Název projektu anglicky

Dynamic changes of mitochondrial DNA and transcription profiles in Silene vulgaris

Anotace anglicky

S. vulgaris is a natural model of mtch genomic fluidity, occurring also in some lineages of crop plants. We aim to analyze in details polymorphism in mitochondrial (mtch) DNA and in the transcription profiles of mtch genes of S. vulgaris, and to identifythe nuclear genes which may control it. The main goals of this proposal are: to study association between expression profiles of mtch genes and mtch DNA polymorphism in Silene vulgaris, to estimate whether editing of mtch RNA differs among haplotypes, and to compare a ratio of particular gene copies and corresponding transcript levels in various organs of heteroplasmic individuals of S. vulgaris.To further examine nuclear genetic background controlling mtch genome fluidity, S. vulgaris homologs of MSH1and RECA3 genes will be identified. These genes control recombination and replication of mtch DNA in Arabidopsis. Expression pattern of their homologs in various organs and developmental stages of female and hermaphroditic individuals of S. vulgaris will be determined.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

EB - Genetika a molekulární biologie

CEP - vedlejší obor

GE - Šlechtění rostlin

CEP - další vedlejší obor

EF - Botanika

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>10611 - Plant sciences, botany<br>10612 - Mycology<br>30101 - Human genetics<br>40105 - Horticulture, viticulture<br>40106 - Agronomy, plant breeding and plant protection; (Agricultural biotechnology to be 4.4)

Hodnocení poskytovatelem

V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Řešení projektu přineslo řadu původních vědeckých výsledků v oblasti variability mitochondriálního genomu. Výsledky byly publikovány nebo přijaty k publikaci celkem do 4 WoS časopisů, které ve všech případech výrazně přesahují medián oboru (New Phytol.,?

Zahájení řešení

1. 1. 2009

Ukončení řešení

31. 12. 2012

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

1. 4. 2012

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP13-GA0-GA-U/02:3

Datum dodání záznamu

17. 5. 2016

Celkové uznané náklady

2 290 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

2 290 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč