Konstrukce chromozómově specifických DNA knihoven ječmene (Hordeum vulgare L.) a jejich využití pro mapování genomu

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Standardní projekty

Veřejná soutěž

—

Hlavní účastníci

Ústav experimentální botaniky AV ČR, v. v. i.

Druh soutěže

—

Číslo smlouvy

—

Název projektu anglicky

Construction of chromosome-specific DNA libraries of barley (Hordeum vulgare L.) and their use in genome mapping

Anotace anglicky

The project assumes construction of chromosome-specific DNA libraries for some of barley chromosomes. Translocation lines of barley will be used to increase efficiency of sorting. Methods for isolation and flow-cytometric sorting of barley chromosomes will be developed. DNA from sorted chromosomes will be amplified by degenerate-oligonucleotide primed PCR (DOP-PCR) and used for construction of recombinant DNA libraries. The libraries will be characterised as for insert size, reperesentativness and content of single-copy and repeated sequences. Barley cDNA will be prepared and hybridised with chromosome-specific DNA to obtain chromosome-specific population of cDNAs. The chromosome-specific libraries are expected to be used for isolation of chromosome-specific markers and for localisation of DNA sequences on chromosomes and their parts. Chromosome-specific cDNAs will be used to attempt at preparing probes for chromosome painting.

Kategorie VaV

—

CEP - hlavní obor

GE - Šlechtění rostlin

CEP - vedlejší obor

EB - Genetika a molekulární biologie

CEP - další vedlejší obor

EF - Botanika

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>10611 - Plant sciences, botany<br>10612 - Mycology<br>30101 - Human genetics<br>40105 - Horticulture, viticulture<br>40106 - Agronomy, plant breeding and plant protection; (Agricultural biotechnology to be 4.4)

Hodnocení poskytovatelem

V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Postup a metodika prací jsou v souladu se stanoveným záměrem. Práce je adekvátně publikována ve 2 článcích in extenzo, 1 odeslán do tisku, řada příspěvků na konferencích. Finanční prostředky čerpány v souladu s plánem.

Zahájení řešení

1. 1. 1998

Ukončení řešení

1. 1. 2000

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

—

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP/2001/GA0/GA01GA/U/N/9:4

Datum dodání záznamu

—

Celkové uznané náklady

652 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

530 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč