Ekologie a fylogeneze rodu Geosmithia a jeho vztah ke kůrovci druhu Scolytus intricatus a rozkladu dřeva
Cíle projektu
Fylogenetická analýza rDNA sekvencí rodu Geosmíthia prokázala, že osm druhu náleží mezi Eurotiales a dva druhy do řádu Hypocreales. Geosmithie jsou považovány za vzácné, avšak v našich předchozích studiích (GAČR 203/97/0037) jsme je často nalézali v kambiu odumírajících dubů napadených kůrovcem Scolytus intricatus, v jeho chodbičkách, na těle hmyzu i larev. Byly nalezeny čtyři morfologicky rozlišené skupin geosmithii z nichž pouze jedna přibližně odpovídala druhu G. putterilln. Cílem projektu je objasnit vztah mezi kambiálním výskytem geosmithii, přítomností hmyzu a odumíráním dubu a tak přispět ke znalostem o ekologii tohoto systému. Izolovali jsme více než 70 kmenů z asociace Scolytus/Quercus a sběry budou pokračovat v oblastech s převládajícími dubovými lesy, na různých druzích dubu a jiných opadavých dřevin, na dřevinách s různým stupněm napadení a dalších druzích hmyzu. Morfologická studie a analýza rDNa sekvencí ukázala, že naše isoláty náleží do řádu Hypocreales. Provedeme
Klíčová slova
Veřejná podpora
Poskytovatel
Grantová agentura České republiky
Program
Standardní projekty
Veřejná soutěž
Standardní projekty 1 (SGA02002GA-ST)
Hlavní účastníci
Mikrobiologický ústav AV ČR, v. v. i.
Druh soutěže
VS - Veřejná soutěž
Číslo smlouvy
—
Alternativní jazyk
Název projektu anglicky
Ecology and phylogeny of the genus Geosmithia and its relationship to bark beetle Scolytus intricatus and the decomposition of wood
Anotace anglicky
In a previous study of microfungi associated with bark beetle S. intricatus and the decline of oaks, Geosmithia species appeared among the most frequent fungi. Geosmithia is a polyphyletic taxon with two species belonging to Hypocreales and eight to Eurotiales. The main aim of our project is to find a relationship among the cambial occurrence of geosmithias, presence of insects and the decline of oaks and contribute thus to knowledge on ecology. We have isolated over 70 strains from Scolytus/Quercusassociation and the sampling will continue in areas with prevailing oak woods, from different oak species, trees with various degrees of disease and other insects feeding on the wood/bark interface. Morphological study and analysis of rDNA sequences confirmed that our isolates differ from species described so far and belong to Hypocreales. Phylogenetic analysis of Geosmithia species will be performed using rDNA sequences. Ex type strains from established collections and database sequences will be
Vědní obory
Kategorie VaV
ZV - Základní výzkum
CEP - hlavní obor
EB - Genetika a molekulární biologie
CEP - vedlejší obor
EH - Ekologie – společenstva
CEP - další vedlejší obor
—
OECD FORD - odpovídající obory
(dle převodníku)10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)
10605 - Developmental biology
10608 - Biochemistry and molecular biology
10609 - Biochemical research methods
10618 - Ecology
10619 - Biodiversity conservation
30101 - Human genetics
Hodnocení dokončeného projektu
Hodnocení poskytovatelem
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Zhodnocení výsledků projektu
Floémofágní kůrovci (Coleoptera: Scolytidae) přenášejí různé druhy hub. Známá je skupina jilmových kůrovců přenášející ophiostomatální houby. Kromě toho jsme nalezli kůrovce, asociované s houbami rodu Geosmithia a další skupinu s tzv. "nespecifickou" myk
Termíny řešení
Zahájení řešení
1. 1. 2002
Ukončení řešení
1. 1. 2004
Poslední stav řešení
U - Ukončený projekt
Poslední uvolnění podpory
—
Dodání dat do CEP
Důvěrnost údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Systémové označení dodávky dat
CEP/2005/GA0/GA05GA/U/N/B:7
Datum dodání záznamu
2. 6. 2008
Finance
Celkové uznané náklady
2 242 tis. Kč
Výše podpory ze státního rozpočtu
1 230 tis. Kč
Ostatní veřejné zdroje financování
1 012 tis. Kč
Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.
0 tis. Kč
Základní informace
Uznané náklady
2 242 tis. Kč
Statní podpora
1 230 tis. Kč
54%
Poskytovatel
Grantová agentura České republiky
CEP
EB - Genetika a molekulární biologie
Doba řešení
01. 01. 2002 - 01. 01. 2004