Analýza genomu viru mozaiky ředkvičky (Comovirus)

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Standardní projekty

Veřejná soutěž

Standardní projekty 10 (SGA02007GA-ST)

Hlavní účastníci

—

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

522/07/0053

Název projektu anglicky

Analysis of Radish mosaic virus (Comovirus) genome

Anotace anglicky

Unique collection of about 20 world isolates of radish mosaic virus (RaMV) has been created and is maintained at the IPMB. RaMV is the last worldwide-distributed comovirus of high economic importance (infecting brassicas), for which no sequence data areavailable. We propose to identify its complete genome sequence, analyse capsid proteins sequence variability of world isolates, sequence and compare distant sites of the genome of several isolates to confirm hypothesis of natural recombination in comoviruses. We will characterize a new brassica-infecting comovirus, recently isolated form turnip in USA and compare it with RaMV.  The benefits of the project are in the first molecular improvement of detailed knowledge of the virus genome. The capsidproteinsequence variability analysis brings unique data that will be compared and complemented with the serological and RaMV host range analysis data from our previous studies. No similar analysis of serotypes or isolates has been conducted on viruses

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

EE - Mikrobiologie, virologie

CEP - vedlejší obor

EB - Genetika a molekulární biologie

CEP - další vedlejší obor

—

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10606 - Microbiology<br>10607 - Virology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics

Hodnocení poskytovatelem

V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Projekt byl řešen v souladu s plánem a byly získány unikátní poznatky o struktuře genomu viru mozaiky ředkvičky (RaMV) a byl identifikován dosud neklasifikovaný Turnip ringspot virus (TuRSV). Studium variability genomů RaMV a TuRSV virů nepotvrdilo, že ?

Zahájení řešení

1. 1. 2007

Ukončení řešení

31. 12. 2009

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

22. 4. 2009

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP10-GA0-GA-U/02:2

Datum dodání záznamu

22. 1. 2015

Celkové uznané náklady

2 313 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

2 313 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč