Interakce disulfidových skupin v molekulách proteinů a peptidů - komplementární užití elektronové a vibrační optické aktivity
Cíle projektu
Budeme studovat vliv vzájemných interakcí disulfidových skupin v molekulách peptidů a proteinů. Ověříme platnost již dříve námi nalezených vztahů mezi geometrií disulfidové skupiny a chiroptickými vlastnostmi (elektronovým cirkulárním dichroismem - ECD a optickou aktivitou v Ramanových spektrech – ROA) v situacích, kdy je v molekule přítomna více nežli jedna taková skupina. Vyhodnotíme možnost detekce a konformační analýzy disulfidových skupin v přítomnosti skupin amidových. Prostudujeme velikost vzájemných interakcí v elektronových spektrech (počet dichroických pásů a jejich štěpení) a možnosti a limitace separátního pozorování jednotlivých disulfidových skupin pomocí pásů C-S a S-S valenčních vibrací v Ramanových a zejména ROA spektrech.
Klíčová slova
disulphidegroupopticalactivityconformationcirculardichroismRamanopticalactivity
Veřejná podpora
Poskytovatel
Grantová agentura České republiky
Program
Standardní projekty
Veřejná soutěž
Standardní projekty 13 (SGA02010GA-ST)
Hlavní účastníci
Univerzita Karlova / Matematicko-fyzikální fakulta
Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i.Druh soutěže
VS - Veřejná soutěž
Číslo smlouvy
P205-10-1276
Alternativní jazyk
Název projektu anglicky
Interactions of disulfide groups in peptide/ protein molecules - complementary use of electronic and vibrational optical activity
Anotace anglicky
We will study impact of mutual interactions of disulphide groups in peptides and proteins. We would like to verify already established relationship between disulphide geometry and chiroptical properties (electronic circular dichroism - ECD and Raman optical activity - ROA) under the circumstances when more than one disulphide group is present in a molecule. Moreover, possibility to detect and conformationally analyze disulphide groups in a presence of amide groups will be evaluated. We also plan to investigate magnitude of mutual interactions in electronic spectra (number of dichroic bands and their splitting) and possibilities and limitations of observation of individual disulphide groups on the basis of C-S and S-S- stretching vibrational bands in Raman and particularly ROA spectra.
Vědní obory
Kategorie VaV
ZV - Základní výzkum
CEP - hlavní obor
BO - Biofyzika
CEP - vedlejší obor
CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie
CEP - další vedlejší obor
—
OECD FORD - odpovídající obory
(dle převodníku)10403 - Physical chemistry
10610 - Biophysics
Hodnocení dokončeného projektu
Hodnocení poskytovatelem
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Zhodnocení výsledků projektu
Záměr i cíle projektu byly naplněny. Projekt dosáhl podstatných výsledků v oblasti studia vzájemných interakcí disulfidových skupin v molekulách peptidů a proteinů. Přínosné je i zapojení dvou doktorandů do řešení projektu. Výsledky projektu byly publikovány ve třech publikacích. Publikační výstupy jsou adekvátní rozsahu projektu a počtu členů řešitelského týmu.
Termíny řešení
Zahájení řešení
1. 1. 2010
Ukončení řešení
27. 1. 2014
Poslední stav řešení
U - Ukončený projekt
Poslední uvolnění podpory
1. 4. 2014
Dodání dat do CEP
Důvěrnost údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Systémové označení dodávky dat
CEP15-GA0-GA-U/01:2
Datum dodání záznamu
30. 9. 2017
Finance
Celkové uznané náklady
2 241 tis. Kč
Výše podpory ze státního rozpočtu
2 241 tis. Kč
Ostatní veřejné zdroje financování
0 tis. Kč
Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.
0 tis. Kč
Základní informace
Uznané náklady
2 241 tis. Kč
Statní podpora
2 241 tis. Kč
100%
Poskytovatel
Grantová agentura České republiky
CEP
BO - Biofyzika
Doba řešení
01. 01. 2010 - 27. 01. 2014