Vývoj metodologie s vysokým rozlišením pro NMR studie neuspořádaných proteinů s vysoce degenerovanými rezonančními frekvencemi

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Standardní projekty

Veřejná soutěž

Standardní projekty 14 (SGA02011GA-ST)

Hlavní účastníci

—

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

P206-11-0758

Název projektu anglicky

Development of high-resolution methodology for NMR studies of disordered proteins with highly degenerated resonance frequencies

Anotace anglicky

Description of physical and chemical behavior of unstructured proteins is important for understanding of the process of protein folding in a living cell. Moreover, many proteins are intrinsically disordered in their physiological form and play an important role in various pathological processes. Nuclear magnetic resonance (NMR) is very well suited for the study of disordered proteins, but the standard NMR experiments do not provide sufficient resolution for some applications. We propose to develop a suite of NMR experiments with a high resolution, achieved by combination of direct carbon detection, nonuniform sampling, and high dimensionality of the measured spectra. Such methods will allow to study residual structural features and internal motions ofdisordered proteins with very high degeneracy of frequencies, typical e.g. for highly repetitive amino-acid sequences.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

CB - Analytická chemie, separace

CEP - vedlejší obor

CE - Biochemie

CEP - další vedlejší obor

BO - Biofyzika

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10406 - Analytical chemistry<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>10610 - Biophysics

Hodnocení poskytovatelem

U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Cíle projektu byly plně splněny. Byly vyvinuty metodiky vícerozměrných NMR experimentů pro analýzu vnitřně neuspořádaných proteinů, přiřazení rezonančních frekvencí a určení residuálních dipolárních kaplingů. Metodika byla využita při charakterizaci něk?

Zahájení řešení

1. 1. 2011

Ukončení řešení

31. 12. 2013

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

12. 6. 2013

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP14-GA0-GA-U/01:1

Datum dodání záznamu

1. 7. 2014

Celkové uznané náklady

3 588 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

3 588 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč