Vliv konformace a chemické modifikace na chování oligonukleotidů na elektrodách: příspěvek k vývoji DNA senzorů

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Standardní projekty

Veřejná soutěž

Standardní projekty 15 (SGA02012GA-ST)

Hlavní účastníci

Biofyzikální ústav AV ČR, v. v. i.

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

P206-12-2378

Název projektu anglicky

Influence of conformation and chemical modification on the behavior of oligonucleotides at electrodes: towards the development of DNA sensors

Anotace anglicky

The project is focused on study of influence of structure and chemical modification of synthetic oligonucleotides (ON) on their electrochemical behavior. In case of double-strand ON will be studied relation between its nucleotide sequence, location of electroactive bases and its electrochemical behavior. Influence of alternative secondary structures (triplexes, hairpins, tetraplexes) formation will be investigated with using of model ON. Similarly will be studied influence of chemical modification. This study will include not only modification of DNA bases (metal complexes, organic functional groups), but also modification of DNA sugar-phosphate backbone (end modification, modification of whole backbone comparison of DNA, RNA and PNA behavior). Findings about electrochemical behavior will be supplement by study of interfacial behavior of these ONs. Acquired results will contribute to understanding of electrochemical and interfacial behavior of ON at different types of electrodes and will be utilized in development of sensors for detection of DNA hybridization and DNA interactions.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

CB - Analytická chemie, separace

CEP - vedlejší obor

CG - Elektrochemie

CEP - další vedlejší obor

—

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10405 - Electrochemistry (dry cells, batteries, fuel cells, corrosion metals, electrolysis)<br>10406 - Analytical chemistry

Hodnocení poskytovatelem

U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Projekt řeší vliv sekundárních struktur DNA, jako např. guanidových tetraplexů a vlásenkové struktury, na elektrochemické chování oligonukleotidů a syntézu elektrochemicky aktivních asociátů deaza analogů purinových bází s komplexem oxidu osmičelého s 2,2’-bipyridinem. Výsledky jsou podkladem pro 4 impaktované publikace.

Zahájení řešení

1. 1. 2012

Ukončení řešení

7. 4. 2016

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

1. 4. 2016

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP17-GA0-GA-U/03:1

Datum dodání záznamu

28. 6. 2017

Celkové uznané náklady

5 517 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

5 517 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč