Mezifázové a elektrochemické chování syntetických oligonukleotidů: vliv nukleotidové sekvence, konformace a chemické modifikace

Poskytovatel

Akademie věd České republiky

Program

Granty výrazně badatelského charakteru zaměřené na oblast výzkumu rozvíjeného v současné době zejména v AV ČR

Veřejná soutěž

Výzkumné granty 9 (SAV02009-A)

Hlavní účastníci

—

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

IAA400040903

Název projektu anglicky

Interfacial and electrochemical behavior of synthetic oligonucleotides: effects of nucleotide sequence, conformation and chemical modification

Anotace anglicky

The project is focused on study of interfacial and electrochemical properties of synthetic oligonucleotides (ON) with respect to their nucleotide sequence, secondary structure and chemical modification. We will study in detail the relations between the ON primary structure, their interactions with electrically charged surfaces and electroactivity of the base residues. Behavior ONs adopting different secondary structures at electrodes (adsorption/desorption properties, accessibility of nucleobases to electrochemical reduction/oxidation, and potential-induced structural changes at the electrode surface) will be investigated. Similarly, chemically modified ONs (e.g.,involving alkylated bases or metal adducts) will be studied. The properties of DNA ONs will be compared with RNA and/or with other synthetic nucleic acids analogues. We expect that results of this project will contribute to understanding of the ON behavior at electrodes and will be utilized in development of novel DNA sensors.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

CG - Elektrochemie

CEP - vedlejší obor

CE - Biochemie

CEP - další vedlejší obor

EB - Genetika a molekulární biologie

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10405 - Electrochemistry (dry cells, batteries, fuel cells, corrosion metals, electrolysis)<br>10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics

Hodnocení poskytovatelem

U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Bylo zjištěno, že tvorba některých alternativních struktur DNA silně ovlivňuje mezifázové a elektrochemické chování ODN tyto struktury tvořících. Byly zavedeny nové metody pro analýzu modifikace DNA komplexy platiny a pro detekci nespárovaných T v DNA.

Zahájení řešení

1. 1. 2009

Ukončení řešení

31. 12. 2011

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

18. 3. 2011

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP12-AV0-IA-U/02:2

Datum dodání záznamu

28. 6. 2013

Celkové uznané náklady

2 112 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

2 112 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč