Využití elektrochemických metod při studiu oligonukleotidů jako modelů alternativních struktur DNA
Veřejná podpora
Poskytovatel
Akademie věd České republiky
Program
Granty výrazně badatelského charakteru zaměřené na oblast výzkumu rozvíjeného v současné době zejména v AV ČR
Veřejná soutěž
Výzkumné granty 6 (SAV02006-A)
Hlavní účastníci
—
Druh soutěže
VS - Veřejná soutěž
Číslo smlouvy
IAA400040611
Alternativní jazyk
Název projektu anglicky
Application of electrochemical methods in studies of oligonucleotides as models of unusual DNA structures
Anotace anglicky
We propose to study synthetic oligonucleotides (ODN) using electrochemical techniques at mercury and carbon electrodes. Information about the influence of sequence and length of the ODN on their electrochemical behavior will be obtained. Behavior of ODNadopting various secondary structures (besides duplex form, hairpins, triplexes or quadruplexes) will be studied. Transitions between them are accompanied by changes of accessibility of certain base residues influencing the electrochemical signals. Formation of the alternative structures occurs under different conditions (pH, presence of metal ions); most of the experiments will be therefore performed in medium exchange mode enabling to change conditions under which the ODN are adsorbed at electrodes while keeping conditions of the measurements constant. Besides improvement of basic knowledge in the field of DNA electrochemistry, one of the project goals is to propose novel analytical approaches applicable in practical DNA diagnostics.
Vědní obory
Kategorie VaV
ZV - Základní výzkum
CEP - hlavní obor
CG - Elektrochemie
CEP - vedlejší obor
CE - Biochemie
CEP - další vedlejší obor
EB - Genetika a molekulární biologie
OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)
10405 - Electrochemistry (dry cells, batteries, fuel cells, corrosion metals, electrolysis)<br>10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics
Hodnocení dokončeného projektu
Hodnocení poskytovatelem
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Zhodnocení výsledků projektu
Byly získány informace o vlivu počtu, typu a polohy elektroaktivních bází v molekule na elektrochemické chování jedno i dvou řetězcových syntetických oligonukleotidů (ODN). Byl navržen senzor hybridizace DNA založený na použití ODN tvořících vlásenky.
Termíny řešení
Zahájení řešení
1. 1. 2006
Ukončení řešení
31. 12. 2008
Poslední stav řešení
U - Ukončený projekt
Poslední uvolnění podpory
21. 2. 2008
Dodání dat do CEP
Důvěrnost údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Systémové označení dodávky dat
CEP09-AV0-IA-U/01:1
Datum dodání záznamu
2. 7. 2009
Finance
Celkové uznané náklady
1 446 tis. Kč
Výše podpory ze státního rozpočtu
1 446 tis. Kč
Ostatní veřejné zdroje financování
0 tis. Kč
Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.
0 tis. Kč