Využití elektrochemických metod při studiu oligonukleotidů jako modelů alternativních struktur DNA

Poskytovatel

Akademie věd České republiky

Program

Granty výrazně badatelského charakteru zaměřené na oblast výzkumu rozvíjeného v současné době zejména v AV ČR

Veřejná soutěž

Výzkumné granty 6 (SAV02006-A)

Hlavní účastníci

—

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

IAA400040611

Název projektu anglicky

Application of electrochemical methods in studies of oligonucleotides as models of unusual DNA structures

Anotace anglicky

We propose to study synthetic oligonucleotides (ODN) using electrochemical techniques at mercury and carbon electrodes. Information about the influence of sequence and length of the ODN on their electrochemical behavior will be obtained. Behavior of ODNadopting various secondary structures (besides duplex form, hairpins, triplexes or quadruplexes) will be studied. Transitions between them are accompanied by changes of accessibility of certain base residues influencing the electrochemical signals. Formation of the alternative structures occurs under different conditions (pH, presence of metal ions); most of the experiments will be therefore performed in medium exchange mode enabling to change conditions under which the ODN are adsorbed at electrodes while keeping conditions of the measurements constant. Besides improvement of basic knowledge in the field of DNA electrochemistry, one of the project goals is to propose novel analytical approaches applicable in practical DNA diagnostics.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

CG - Elektrochemie

CEP - vedlejší obor

CE - Biochemie

CEP - další vedlejší obor

EB - Genetika a molekulární biologie

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10405 - Electrochemistry (dry cells, batteries, fuel cells, corrosion metals, electrolysis)<br>10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics

Hodnocení poskytovatelem

U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Byly získány informace o vlivu počtu, typu a polohy elektroaktivních bází v molekule na elektrochemické chování jedno i dvou řetězcových syntetických oligonukleotidů (ODN). Byl navržen senzor hybridizace DNA založený na použití ODN tvořících vlásenky.

Zahájení řešení

1. 1. 2006

Ukončení řešení

31. 12. 2008

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

21. 2. 2008

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP09-AV0-IA-U/01:1

Datum dodání záznamu

2. 7. 2009

Celkové uznané náklady

1 446 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

1 446 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč