Molekulární mechanismus autokatalytického proteinového sestřihu RTX proteinu FrpC z Neisseria meningitidis

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Standardní projekty

Veřejná soutěž

Standardní projekty 14 (SGA02011GA-ST)

Hlavní účastníci

Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích / Přírodovědecká fakulta<br>Mikrobiologický ústav AV ČR, v. v. i.

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

P207-11-0717

Název projektu anglicky

Molecular mechanism of autocatalytic protein splicing of the RTX protein FrpC from Neisseria meningitidis

Anotace anglicky

Protein splicing is a unique mechanism of autocatalytic protein editing directly at polypeptide level. Recently, we identified a calcium-dependent self-processing module (SPM) inside the FrpC protein of Neisseria meningitidis that mediates autocatalytic cleavage of the Asp-Pro peptide bond and formation of an isopeptide bond of the newly released carboxyl of the Asp residue with ε-amino group of adjacent Lys residue (protein trans-splicing). The aim of this project is to determine the structure-function relationships underlying the mechanism of SPM-based protein splicing and its potential use in protein engineering. The project will focus on determination of the three-dimensional structure of SPM, which enables a deeper insight into a novel type of autocatalytic cleavage of the Asp-Pro peptide bond and the role of calcium ions in the conformational change of SPM during autocatalytic processing. The capacity of the newly generated fragment to form covalent linkage with amine group will be exploited for development of SPM-based protein ligation technology.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

CE - Biochemie

CEP - vedlejší obor

EB - Genetika a molekulární biologie

CEP - další vedlejší obor

EE - Mikrobiologie, virologie

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10606 - Microbiology<br>10607 - Virology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics

Hodnocení poskytovatelem

U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Byla provedena strukturní a funkční charakterizace tzv. samoštěpitelného modulu, který se nachází uvnitř polypeptidového řetězce řady proteinů gram-pozitivních bakterií. Výsledky byly publikovány v kvalitních odborných časopisech.

Zahájení řešení

1. 1. 2011

Ukončení řešení

31. 12. 2015

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

26. 5. 2015

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP16-GA0-GA-U/01:1

Datum dodání záznamu

25. 9. 2017

Celkové uznané náklady

14 100 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

14 100 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč