Teoretické a spektroskopické studie agregátů nukleových kyselin

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Standardní projekty

Veřejná soutěž

Standardní projekty 13 (SGA02010GA-ST)

Hlavní účastníci

Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i.

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

P208-10-0559

Název projektu anglicky

Theoretical and spectroscopic studies of nucleic acid self-assemblies

Anotace anglicky

Nucleic acid self-assemblies attract attention because of their intrigue nature, and potential medicinal and industrial applications. In this project extended experimental and theoretical procedures allowing classifying various types of nucleic acid self-assemblies are proposed. Multiple-stranded nucleic acid formations will include four-stranded i-DNA and G-quadruplexes. The results will enable further investigations of the DNA compacting occurring during the packing in cell nuclei. Primarily, the optical spectroscopic techniques of electronic circular dichroism (ECD), infrared absorption (IR), vibrational circular dichroism (VCD), Raman scattering, and Raman optical activity (ROA) will be used. The measurements will be supported by molecular dynamics simulations combined with ab initio computations of nucleic acid properties. Standard coupled oscillator theory will be extended and combined with the ab initio procedures. Such a multi-scale approach will result in a faithful simulating of the optical spectra including the dynamics and environmental (solvent/ionic) effects that can be validated by the spectroscopic experiments.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie

CEP - vedlejší obor

—

CEP - další vedlejší obor

—

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10403 - Physical chemistry

Hodnocení poskytovatelem

U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Projekt zabývající se studium struktury, stability a dynamiky biomolekul a jejich komplexů kombinací experimentálních spektroskopických a teoretických přístupů byl řešen v souladu s navrženým plánem. Bylo dosaženo řady zajímavých výsledků, které byly publikovány v 7 článcích v recenzovaných impaktovaných časopisech a jedné kapitole v knize.

Zahájení řešení

1. 1. 2010

Ukončení řešení

31. 12. 2012

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

1. 4. 2012

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP13-GA0-GA-U/04:1

Datum dodání záznamu

5. 5. 2020

Celkové uznané náklady

2 437 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

2 437 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč