Studium vlivu mezimolekulových interakcí na povahu elektronicky excitovaných stavů bází nukleových kyselin
Cíle projektu
Předmětem projektu je studium povahy elektronicky excitovaných stavů bází nukleových kyselin. Pro studium bude použito modelů nukleových kyselin umožňující popsat povahu interakcí bází v elektronicky excitovaných stavech a studovat charakter excitovanýchstavů v závislosti na sekvenci bází. Tato studie se bude zabývat otázkou, jak sekvence bází ovlivňuje tvorbu excimerů, excitonů, stavů s přenosem náboje a lokalizaci excitovaných stavů na jednotlivých bázích s následným dopadem na fotodynamické chováníbází nukleových kyselin. Vliv okolních bází na dynamickou povahu relaxace z excitovaného do základního stavu bude studován "on-the-fly surface hopping" metodou zahrnující neadiabatické spřažení. K tomuto účelu budou použity reálnější modely obsahující sousední báze nukleových kyselin a hybridní QM/MM metoda. Dynamická studie s neadiabatickým spřažením bude použita i pro studium dynamiky fotochemických reakcí v závislosti na povaze excitovaných stavů. K tomu účelu budou použity menší biologickyrelevantní systémy.
Klíčová slova
Excitedstatesnucleicacidbaseshybridquantummechanical-molecularmechanicaldescriptionnonadiabaticphotodynamics
Veřejná podpora
Poskytovatel
Grantová agentura České republiky
Program
Standardní projekty
Veřejná soutěž
Standardní projekty 15 (SGA02012GA-ST)
Hlavní účastníci
—
Druh soutěže
VS - Veřejná soutěž
Číslo smlouvy
P208-12-1318
Alternativní jazyk
Název projektu anglicky
Study of Effects of Intermolecular Interactions on the Character of Electronically Excited States of Nucleic Acids Bases
Anotace anglicky
The project includes the study of the nature of nucleic acid bases in their electronically excited states. Large models of nucleic acids which account for interactions of nucleic acid bases in their electronically excited states will be used. The character of the excited states of nucleic acid bases depending on the base sequence will be investigated. These studies will address the question how the base sequence influences the excimer and exciton formation, the states characterized by a charge transferor by localization of excited state on a single base. The dynamics of the excited state relaxation will be studied employing "on-the-fly surface hopping" nonadiabatic dynamics simulations with models which include surrounding bases. The hybridQM/MM method will be used for these studies. Nonadiabatic dynamics calculations will be also used to study the time scales of photochemical reactions depending on the character of excited states using small biologically relevant model systems.
Vědní obory
Kategorie VaV
ZV - Základní výzkum
CEP - hlavní obor
CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie
CEP - vedlejší obor
—
CEP - další vedlejší obor
—
OECD FORD - odpovídající obory
(dle převodníku)10403 - Physical chemistry
Hodnocení dokončeného projektu
Hodnocení poskytovatelem
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Zhodnocení výsledků projektu
Všech 5 publikací v kvalitních časopisech + 2 v redakčním řízení se věnuje studiu vlastností elektronicky excitovaných molekul. Cíle projektu byly splněny výborně po metodologické stránce, studium heterodimerů bází bylo naplněno z velké části, navíc byl?
Termíny řešení
Zahájení řešení
1. 1. 2012
Ukončení řešení
31. 12. 2014
Poslední stav řešení
U - Ukončený projekt
Poslední uvolnění podpory
31. 3. 2014
Dodání dat do CEP
Důvěrnost údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Systémové označení dodávky dat
CEP15-GA0-GA-U/01:1
Datum dodání záznamu
22. 5. 2015
Finance
Celkové uznané náklady
1 705 tis. Kč
Výše podpory ze státního rozpočtu
1 705 tis. Kč
Ostatní veřejné zdroje financování
0 tis. Kč
Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.
0 tis. Kč
Základní informace
Uznané náklady
1 705 tis. Kč
Statní podpora
1 705 tis. Kč
100%
Poskytovatel
Grantová agentura České republiky
CEP
CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie
Doba řešení
01. 01. 2012 - 31. 12. 2014