Analýza a modelování genové exprese vedoucí k detekci regulačních RNA ovlivňujících produkci antibiotik u streptomycet

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Standardní projekty

Veřejná soutěž

Standardní projekty 13 (SGA02010GA-ST)

Hlavní účastníci

—

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

P302-10-0468

Název projektu anglicky

Analysis and modelling of gene expression in search for regulatory RNAs affecting antibiotic production in Streptomyces

Anotace anglicky

Recently, it has become clear that gene expression is controlled not only by regulatory proteins but also by small RNAs (sRNAs). A large majority of these sRNAs have been shown to regulate gene expression post-transcriptionally by means of sequence complementarity with their target mRNAs forming double stranded RNAs. Ribonucleases (RNases) have a major impact on sRNA regulatory pathways. Double stranded RNAs are recognized and cleaved by RNase III enzyme. Streptomycetes are important antibiotic producers with a complex life cycle, where the developmental transitions are subjected to complicated and not yet fully understood control mechanisms. The S. coelicolor RNase III null mutant does not produce antibiotics. The proposed project will compare globalgene expression in S. coelicolor wild type strain and in its cognate RNase III null mutant in order to search for novel sRNA regulators. Those sRNAs affecting cell differentiation and antibiotic production will be analyzed. Moreover, a numerical model based on expression profiles of such regulated proteins will be created to predict other sRNA-regulations.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

EE - Mikrobiologie, virologie

CEP - vedlejší obor

—

CEP - další vedlejší obor

—

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10606 - Microbiology<br>10607 - Virology

Hodnocení poskytovatelem

V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Popsán vliv 6S RNA na produkci antibiotik u streptomycet. Antisense RNA modifikují expresi sigma faktorů a pleiotropního regulátoru AdpA, přímo ovlivňujícího produkci antibiotik. Projekt byl významný i pro odbornou přípravu studentů. Výsledky projektu b?

Zahájení řešení

1. 1. 2010

Ukončení řešení

31. 12. 2014

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

31. 3. 2014

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP15-GA0-GA-U/01:1

Datum dodání záznamu

22. 5. 2015

Celkové uznané náklady

6 745 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

6 745 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč