Molekulární mechanismy přežití bakterií v nepříznivých podmínkách

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Postdoktorandské granty

Veřejná soutěž

Postdoktorandské granty 14 (SGA0201300006)

Hlavní účastníci

Mikrobiologický ústav AV ČR, v. v. i.

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

13-27150P

Název projektu anglicky

Molecular mechanisms of bacterial survival in harsh conditions

Anotace anglicky

Bacteria spend most of their lives in stationary phase. Consequently, stationary phase adaptations are crucial for their survival and for survival of pathogens in hosts. In stationary phase, a key regulatory molecule is 6S RNA that inhibits RNA polymerase in complex with the primary sigma factor and thereby reprograms gene expression. Until now, 6S RNA has not been found in mycobacteria that include important human pathogens. Our aim is to study regulation of transcription during stationary phase in Mycobacterium smegmatis, which is related to pathogenic species. We ask whether M. smegmatis utilizes 6S RNA similarly to other bacteria or whether mycobacteria have evolved a different mechanism of gene reprograming independent of 6S RNA, such as replacing 6S RNA with inhibitory proteins. Alternatively, other small RNAs could regulate stationary phase in mycobacteria. Recently, we have identified Ms1 sRNA, a highly abundant transcript in stationary phase cells that affects overall gene expression by an unknown mechanism and we will also focus on deciphering its function.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

EE - Mikrobiologie, virologie

CEP - vedlejší obor

EB - Genetika a molekulární biologie

CEP - další vedlejší obor

—

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10606 - Microbiology<br>10607 - Virology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics

Hodnocení poskytovatelem

U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Při studiu molekulárního mechanismu přežití mykobakterií v nepříznivých podmínkách bylo zjištěno, že Ms1 RNA se váže na RNA polymerázu a je jedním z hlavních regulátorů genové exprese mykobakterií. Bylo dále zjištěno, že Ms-1 nemá efekt na transkripci genů závislých na sigma A. Výstupem grantu je jedna publikace a dva manuskripty. Ms1 je potenciálním cílem antibiotik pro léčbu tuberkulózy.

Zahájení řešení

1. 2. 2013

Ukončení řešení

5. 12. 2018

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

12. 6. 2017

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP19-GA0-GP-U/03:1

Datum dodání záznamu

11. 6. 2019

Celkové uznané náklady

2 578 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

2 578 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč