Nové regulační RNA interagující s bakteriálním trankripčním systémem

Název projektu anglicky
Novel regulatory RNAs interacting with the transcription machinery in bacteria
Anotace anglicky
Regulatory 6S RNA molecules that interact with RNA polymerase (RNAP) in complex with the primary sigma factor are widespread among bacteria. In Mycobacterium smegmatis, we discovered a new type of small RNA which binds to RNAP core, named it Ms1 and showed that Ms1 regulates the amount of RNAP. We found Ms1 homologs in other actinobacteria, e.g. scr3559 sRNA binds RNAP core in Streptomyces coelicolor. We plan to perform RIP-seq (RNA immunoprecipitation and next-generation sequencing) to identify a complete set of RNAs interacting with the transcription machinery in M. tuberculosis, Bifidobacterium bifidum and Corynebacterium glutamicum, where no 6S/Ms1 have been reported. Our preliminary data show that in addition to 6S/Ms1, other RNAs associate with bacterial RNAP. These novel RNAP-binding RNAs suggest the existence of so far unknown mechanisms of bacterial transcription regulation and we will focus on their function(s). We propose that 6S RNA and Ms1 were the first RNAs identified due to their high abundance; but other; less abundant regulatory RNAs are waiting to be discovered.

Kategorie VaV
ZV - Základní výzkum
OECD FORD - hlavní obor
30303 - Infectious Diseases
OECD FORD - vedlejší obor
—
OECD FORD - další vedlejší obor
—
CEP - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)
FN - Epidemiologie, infekční nemoci a klinická imunologie

Důvěrnost údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Systémové označení dodávky dat
CEP23-GA0-GA-R
Datum dodání záznamu
17. 3. 2023

Podobné projekty(10)