Množství RNA polymerázy v mykobakterích - jak je řízeno a jak ovlivňuje buňku

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Standardní projekty

Veřejná soutěž

SGA0202000001

Hlavní účastníci

Mikrobiologický ústav AV ČR, v. v. i.

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

20-07473S

Název projektu anglicky

The RNA polymerase amount in mycobacteria - how it is regulated and how it affects the cell

Anotace anglicky

Mycobacterial RNA polymerase (RNAP) is the target of rifampicin, an important drug used in the treatment of tuberculosis caused by Mycobacterium tuberculosis. The resistance to rifampicin is influenced by the RNAP level in mycobacterial cell. Previously, we discovered a small RNA named Ms1 that binds RNAP in M. smegmatis. We found that Ms1 increases the amount of RNAP during stationary phase of growth, when the conditions are unfavorable. Now, we propose to describe factors that regulate RNAP expression, to reveal mechanism of how Ms1 increases the RNAP level and to answer whether Ms1 contributes to rifampicin resistance. We will focus on the unusually long 5´UTR of rpoB-rpoC genes encoding two major RNAP subunits. Based on preliminary data, 5´UTR of RpoB-RpoC mRNA folds into a structure similar to Ms1 and can strongly bind RNAP. We suggest that RNAP might regulate its own expression and Ms1 participates in this process. Finally, we will study the general effect of RNAP amounts on the mycobacterial transcriptome. This could answer why RNAP amount is self-regulated in mycobacteria.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

OECD FORD - hlavní obor

10606 - Microbiology

OECD FORD - vedlejší obor

—

OECD FORD - další vedlejší obor

—

CEP - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

EE - Mikrobiologie, virologie

Hodnocení poskytovatelem

U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Dlouhodobým cílem projektu bylo porozumět funkci malé SM1 RNA a odpovědět, zda by mohla být použita k vývoji specifických „RNA antibiotik“ zaměřených na jednotlivé bakteriální druhy. SM1 malá RNA by mohla být modifikována a použity jako „RNA antibiotika“, která se zaměří na bakteriální patogeny a ne na ostatní bakterie v lidském mikrobiomu. Výsledky byly zveřejněny ve 4 impaktovaných článcích.

Zahájení řešení

1. 1. 2020

Ukončení řešení

30. 6. 2023

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

1. 4. 2023

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP24-GA0-GA-U

Datum dodání záznamu

21. 5. 2024

Celkové uznané náklady

10 104 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

10 104 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč