Množství RNA polymerázy v mykobakterích - jak je řízeno a jak ovlivňuje buňku
Veřejná podpora
Poskytovatel
Grantová agentura České republiky
Program
Standardní projekty
Veřejná soutěž
SGA0202000001
Hlavní účastníci
Mikrobiologický ústav AV ČR, v. v. i.
Druh soutěže
VS - Veřejná soutěž
Číslo smlouvy
20-07473S
Alternativní jazyk
Název projektu anglicky
The RNA polymerase amount in mycobacteria - how it is regulated and how it affects the cell
Anotace anglicky
Mycobacterial RNA polymerase (RNAP) is the target of rifampicin, an important drug used in the treatment of tuberculosis caused by Mycobacterium tuberculosis. The resistance to rifampicin is influenced by the RNAP level in mycobacterial cell. Previously, we discovered a small RNA named Ms1 that binds RNAP in M. smegmatis. We found that Ms1 increases the amount of RNAP during stationary phase of growth, when the conditions are unfavorable. Now, we propose to describe factors that regulate RNAP expression, to reveal mechanism of how Ms1 increases the RNAP level and to answer whether Ms1 contributes to rifampicin resistance. We will focus on the unusually long 5´UTR of rpoB-rpoC genes encoding two major RNAP subunits. Based on preliminary data, 5´UTR of RpoB-RpoC mRNA folds into a structure similar to Ms1 and can strongly bind RNAP. We suggest that RNAP might regulate its own expression and Ms1 participates in this process. Finally, we will study the general effect of RNAP amounts on the mycobacterial transcriptome. This could answer why RNAP amount is self-regulated in mycobacteria.
Vědní obory
Kategorie VaV
ZV - Základní výzkum
OECD FORD - hlavní obor
10606 - Microbiology
OECD FORD - vedlejší obor
—
OECD FORD - další vedlejší obor
—
CEP - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)
EE - Mikrobiologie, virologie
Termíny řešení
Zahájení řešení
1. 4. 2020
Ukončení řešení
31. 12. 2023
Poslední stav řešení
P - Přerušený víceletý projekt
Poslední uvolnění podpory
8. 4. 2022
Dodání dat do CEP
Důvěrnost údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Systémové označení dodávky dat
CEP23-GA0-GA-R
Datum dodání záznamu
20. 2. 2023
Finance
Celkové uznané náklady
9 592 tis. Kč
Výše podpory ze státního rozpočtu
9 592 tis. Kč
Ostatní veřejné zdroje financování
0 tis. Kč
Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.
0 tis. Kč