Morfogeneze genomu v raných vývojových stádiích C. elegans

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Standardní projekty

Veřejná soutěž

Standardní projekty 14 (SGA02011GA-ST)

Hlavní účastníci

—

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

P302-11-1262

Název projektu anglicky

Morphogenesis of the genome during early embryonic development of C. elegans

Anotace anglicky

The morphogenesis of the genomeis the process whereby linear genetic information folds into a complex three-dimensional shape in the cell nucleus. We hypothesize that this folding proceeds along reproducible patterns during development and cell differentiation. This hypothesis will be tested by analyzing the spatial positioning of co-regulated loci in the early C. elegans embryo,a model that is ideally suited for this purpose because of its invariant cell lineage and synchronous development from individual to individual. The positioning of genes in the C. elegans embryonic cell nuclei will be determined using multicolor 3D DNA FISH and live cell imaging. The imaging data will be analyzed using pattern recognition algorithms. Finally, the developmentalsignificance of gene positioning patterns will be explored using the well-characterized glp-1/Notch cell fate mutant. The finding of reproducible patterns of spatial gene positioning during early embryogenesis would open new avenues of research on genomefunction and gene regulation.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

EA - Morfologické obory a cytologie

CEP - vedlejší obor

EB - Genetika a molekulární biologie

CEP - další vedlejší obor

—

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10601 - Cell biology<br>10602 - Biology (theoretical, mathematical, thermal, cryobiology, biological rhythm), Evolutionary biology<br>10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics

Hodnocení poskytovatelem

U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Cíle projektu byly splněny a umožnily vytvořit nástroje pro studium prostorového uspořádání jádrového chromatinu časných embryí C. elegans. Vytvořený protokol byl publikován v Methods Mol Biol, originální v Plos One. Přehledný článek byl otištěn v recen?

Zahájení řešení

1. 1. 2011

Ukončení řešení

31. 12. 2013

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

19. 6. 2013

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP14-GA0-GA-U/01:1

Datum dodání záznamu

1. 7. 2014

Celkové uznané náklady

5 910 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

5 910 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč