Vývoj methylace CpG promotoru HIV-1 a její vliv na stabilizaci latentního rezervoáru proviru: longitudinální studie u pacientů

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Standardní projekty

Veřejná soutěž

Standardní projekty 15 (SGA02012GA-ST)

Hlavní účastníci

Ústav molekulární genetiky AV ČR, v. v. i.

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

P304-12-1736

Název projektu anglicky

Development of CpG methylation of HIV-1 promoter and its stabilizing effect on the latent provirus reservoir: longitudinal study in patients

Anotace anglicky

Existence of latent HIV-1 reservoir makes the eradication of HIV-1 infection unreal. DNA methylation of retroviral 5' long terminal repeat (LTR) is one of the mechanisms of latency maintenance. In our previous work we have shown that CpG methylation of the 5' LTR tightly controls resistance of latent HIV-1 to reactivation and thus determines the stability of the HIV-1 latency (Blazkova et al., 2009). However, even dense methylation of the 5' LTR did not confer complete resistance to reactivation with some histone deacetylase inhibitors and cellular activators. In our clinical longitudinal study we will analyze the HIV-1 CpG methylation dynamics directly in the latent reservoir of infected patients and we will analyze the reservoir reactivation ex vivo. The specific aims of our project are to characterize the development of CpG methylation of HIV-1 promoter in the latent reservoir during antiviral therapy, and to characterize the effects of CpG methylation on stability of the reservoir against reactivation signals. Our clinical study explores the possible HIV-1 therapeutic strategy.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

EE - Mikrobiologie, virologie

CEP - vedlejší obor

FN - Epidemiologie, infekční nemoci a klinická imunologie

CEP - další vedlejší obor

EB - Genetika a molekulární biologie

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10606 - Microbiology<br>10607 - Virology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics<br>30302 - Epidemiology<br>30303 - Infectious Diseases

Hodnocení poskytovatelem

U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Projekt se zabýval aktuální problematikou latence viru HIV-1. Nebyl splněn druhý ze tří základních cílů projektů. Řešitelka tento fakt zdůvodnila tím, že nebyli pro plnění tohoto cíle vhodní pacienti. Po ročním odložení závěrečné zprávy tříletého projektu je k dispozici jen jedna publikace s IF 4,54.

Zahájení řešení

1. 1. 2012

Ukončení řešení

7. 4. 2016

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

1. 4. 2016

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP17-GA0-GA-U/03:1

Datum dodání záznamu

28. 6. 2017

Celkové uznané náklady

3 885 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

3 885 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč