Vliv acetylace chromatinu na regulaci alternativního sestřihu

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Standardní projekty

Veřejná soutěž

Standardní projekty 13 (SGA02010GA-ST)

Hlavní účastníci

—

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

P305-10-0424

Název projektu anglicky

Regulation of alternative splicing via chromatin acetylation

Anotace anglicky

Alternative splicing (AS) is one of the key steps in gene expression that greatly increases coding potential of our genome. Splicing is regulated by numerous factors but only a limited number of AS events were explained by interaction among splicing regulators and target pre-mRNAs. In this project, we propose to explore a novel mechanism of splicing regulation via chromatin acetylation. Our substantial preliminary data show that inhibition or depletion of histone deacetylases influences a splice-site choice of several mammalian genes. First, we plan to identify additional target genes by DNA exon arrays. It has been shown that splicing factors associate with nascent pre-mRNA during transcription. We propose to follow a hypothesis that histone modifications alter association of splicing factors with nascent pre-mRNA. We will also pursue an alternative hypothesis assuming that chromatin acetylation change speed of RNA polymerase II, which in turn change AS outcome. Finally, we will analyze a role of histone aceylation in AS during muscle cell differentiation.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

EB - Genetika a molekulární biologie

CEP - vedlejší obor

—

CEP - další vedlejší obor

—

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics

Hodnocení poskytovatelem

V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

1. Hlavním přínosem je popsání, jak acetylace histonů ovlivňuje alternativní sestřih. 2. Údaje řešitele jsou adekvátní. 3. Význam pro pochopení fungování organismů. 4. Velmi dobré publikační výstupy (3 publikace v časopisech se slušným IF). 5. Nezaregis?

Zahájení řešení

1. 1. 2010

Ukončení řešení

31. 12. 2013

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

7. 6. 2013

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP14-GA0-GA-U/01:1

Datum dodání záznamu

1. 7. 2014

Celkové uznané náklady

4 813 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

4 813 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč