Pohlavní chromosomy a dynamika transposonů

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Standardní projekty

Veřejná soutěž

Standardní projekty 13 (SGA02010GA-ST)

Hlavní účastníci

—

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

P305-10-0930

Název projektu anglicky

Sex chromosomes and dynamics of transposable elements

Anotace anglicky

The existence and evolution of sex chromosomes is a basic question in evolutionary biology. The Y chromosome is a bizarre part of the genomes, non-recombining, what results in its degeneration and accumulation of repetitive DNA, mostly transposable elements. We will study dynamics of transposable elements on young sex chromosomes of dioecious plant Silene latifolia. First, we will characterize all abundant repetitive elements using our recent 454 sequencing data. Comparison of male and female genomes will reveal elements accumulated on the Y chromosome, what will be confirmed by FISH mapping. Comparison of transposable elements amplified on microdissected sex chromosomes combined with studies of their expression patterns will enable us to decide how active are elements on the sex chromosomes. Together with identification of transposable elements within genes on degenerating Y chromosome and determination of their age give us a detailed picture of the role of transposable elements in shaping genomic and transcriptomic landscape of the young degenerating Y chromosome.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

EB - Genetika a molekulární biologie

CEP - vedlejší obor

—

CEP - další vedlejší obor

—

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics

Hodnocení poskytovatelem

V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Výsledky tohoto projektu zásadním způsobem rozšířily naše znalosti o evoluci pohlavních chromozomů a o chování dynamických složek rostlinných genomů ? transposonů, mikrosatelitů a promiskuitní DNA. Tato data byla publikována ve 14 článcích a jedné kapit?

Zahájení řešení

1. 1. 2010

Ukončení řešení

31. 12. 2014

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

31. 3. 2014

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP15-GA0-GA-U/01:1

Datum dodání záznamu

22. 5. 2015

Celkové uznané náklady

6 160 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

6 160 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč