Molekulární podstata genově specifického mechanismu translační kontroly kvasinkového genu GCN4, a genu jeho savčího funkčního homologa ATF4.

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Standardní projekty

Veřejná soutěž

Standardní projekty 14 (SGA02011GA-ST)

Hlavní účastníci

Mikrobiologický ústav AV ČR, v. v. i.

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

P305-11-0172

Název projektu anglicky

Molecular basis of the gene-specific translational control mechanism of yeast GCN4 and its mammalian functional homologue ATF4.

Anotace anglicky

Exploration of translational control mechanisms provides important insight into regulation of cellular processes such as proliferation, differentiation and apoptosis. We are interested in one such a mechanism called reinitiation (REI) operating in a gene-specific manner. It is based on an ability of the 40S ribosome to resume scanning after translation of a short upstream open reading frame (uORF) for reinitiation at a downstream start codon. The yeast transcription factor GCN4 and its mammalian functional homologue ATF4, both of which are expressed in response to amino acid starvation, undoubtedly provide the best studied examples of REI. The 5’ leader of their mRNAs contains 4 or 2 uORFs, respectively, that together orchestrate a sophisticated regulatory system that is dependent on the availability of the eIF2•GTP•tRNAiMet ternary complex. We wish to investigate 1) a molecular mechanism by which especially uORF1 of both genes enables resumption of scanning of post-termination ribosomes and 2) whether the 3’ UTR of GCN4 also contributes to the overall regulation of its expression.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

EB - Genetika a molekulární biologie

CEP - vedlejší obor

CE - Biochemie

CEP - další vedlejší obor

EE - Mikrobiologie, virologie

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10606 - Microbiology<br>10607 - Virology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics

Hodnocení poskytovatelem

U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Projekt je velmi komplexní a zahrnuje širokou škálu jak experimentálních tak i teoretických metod. Přesto, že ne všechny vytčené cíle byly dosaženy, nebo alespoň podle názoru panelu došlo k jejich modifikaci, dá se projekt celkově považovat za splněný.

Zahájení řešení

1. 1. 2011

Ukončení řešení

7. 4. 2016

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

1. 4. 2016

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP17-GA0-GA-U/03:1

Datum dodání záznamu

28. 6. 2017

Celkové uznané náklady

7 668 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

7 668 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč