Evoluce parazitismu: analýza genomů a klíčových fyziologických funkcí volně žijící améby Mastigamoeba balamuthi a patogena Entamoeba histolytica

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Standardní projekty

Veřejná soutěž

Standardní projekty 14 (SGA02011GA-ST)

Hlavní účastníci

Univerzita Karlova / Přírodovědecká fakulta<br>Ústav molekulární genetiky AV ČR, v. v. i.

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

P305-11-1061

Název projektu anglicky

Evolution of parasitism:analysis of genomes and key physiological functions of free-living Mastigamoeba balamuthi and pathogenic Entamoeba histolytica

Anotace anglicky

In this project we propose a comparative genomic study of free-living protists Mastigamoeba balamuthi and its parasitic relative Entamoeba histolytica. Analyses of genome sequences of free-living relatives of parasitic species are critical for understanding of evolution of parasitism. We expect that comparison of proposed genomes might allow to identify which genome components have been lost and which changes have contributed to the reductive evolution of the genome in relation to parasitism. We might also identify features of parasitic genomes that are related to their free-living ancestry, modifications of ancestral genes facilitating novel function related to adaptations to new niches as well as acquisition of novel genes involved in parasite-host relationship and pathogenicity.The study includes (i) determination of a genome sequence of M. balamuthi and its bioinformatic comparison with the genome sequence available for E. histolytica, and (ii) comparative studies of selected cellular functions that might be associated with a transition of a free-living to parasitic lifestyle.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

EB - Genetika a molekulární biologie

CEP - vedlejší obor

EE - Mikrobiologie, virologie

CEP - další vedlejší obor

—

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10606 - Microbiology<br>10607 - Virology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics

Hodnocení poskytovatelem

V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Projekt se soustředil na komparativní analýzu genomů volně žijícího a lidského parazita s cílem získat nové informace o evoluci parazitizmu. Výsledky byly publikovány v šesti impaktovaných článcích. Grantová pravidla byla dodržena.

Zahájení řešení

1. 1. 2011

Ukončení řešení

25. 4. 2017

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

26. 5. 2015

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP18-GA0-GA-U/02:1

Datum dodání záznamu

4. 5. 2018

Celkové uznané náklady

9 106 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

9 106 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč