Funkční a biochemická charakterizace proteinu Dis3L2, třetího lidského homologu hlavní kvasinkové exosomové nukleázy Dis3p

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Standardní projekty

Veřejná soutěž

Standardní projekty 14 (SGA02011GA-ST)

Hlavní účastníci

—

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

P305-11-1095

Název projektu anglicky

Functional and biochemical characterization of Dis3L2, the third mammalian homolog of the key yeast exosome nuclease Dis3p

Anotace anglicky

 RNA trimming and turnover plays a key role in eukaryotic gene expression regulation. The degradation and trimming at RNA 3-prime ends is catalyzed by an essential protein complex called the exosome. Although, the exosome core includes six potential exoribonucleases, none of them is catalytically active. The main and only active component is the tenth subunit Rrp44p/Dis3p. Its function and activities have only been described in detail in yeast. Mammalian cells encode three Rrp44p sequence homologs; DIS3, DIS3L and DIS3L2. DIS3L2 is the least similar because it lacks the PIN domain, which is in yeast responsible for binding the exosome core and is essential for viability. The aim of this proposal is to investigate in detail DIS3L2 function in human cells, to characterize the RNA substrate repertoir and to describe the biochemical properties such as enzymatic activities and RNA affinity. In regard to the role of Rrp44p in yeast we expect that all three human homologs will have essential roles for cell and organism function in mammals.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

EB - Genetika a molekulární biologie

CEP - vedlejší obor

CE - Biochemie

CEP - další vedlejší obor

EB - Genetika a molekulární biologie

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics

Hodnocení poskytovatelem

V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Projekt byl splněn skvělým způsobem a byly získány významné výsledky. Byla odhalena aktivita DIS3L2 jako exonukleázy specificky targetující uridylované formy microRNA a další výsledky ukazují na významnou roli uridylace v metabolismu RNA a fyziologii bu?

Zahájení řešení

1. 1. 2011

Ukončení řešení

31. 12. 2014

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

18. 4. 2014

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP15-GA0-GA-U/01:1

Datum dodání záznamu

22. 5. 2015

Celkové uznané náklady

10 240 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

10 240 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč