Transkripční pulzování a fenotyp kmenových buněk

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Standardní projekty

Veřejná soutěž

Standardní projekty 15 (SGA02012GA-ST)

Hlavní účastníci

Univerzita Karlova / 1. lékařská fakulta

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

P305-12-1246

Název projektu anglicky

Transcriptional pulsing and the stem cell phenotype

Anotace anglicky

Live cell imaging has recently revealed that transcription is a discontinuous process at the single cell level, with individual genes oscillating between periods of activity and inactivity. Here we propose that such transcriptional pulsing is involved in the process of lineage commitment in embryonic stem (ES) cells. More specifically, that it creates windows of opportunity for cells to enter differentiation pathways. We propose to test this hypothesis by simultaneously imaging in living ES cells the transcription of Pou5f1 and T/brachyury, well-characterized pluripotence- and differentiation-associated genes, respectively. The project calls for the development of a novel GFP-based transcriptional reporter, the establishment of knocked-in ES cell lines and the imaging of differentiating ES cells using state-of-the-art fluorescence microscopy. Realization of this project is expected to shed light on the importance of stochastic mechanisms of gene regulation in stem cell maintenance and differentiation.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

EB - Genetika a molekulární biologie

CEP - vedlejší obor

—

CEP - další vedlejší obor

—

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics

Hodnocení poskytovatelem

U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Cílem projektu bylo zobrazení transkripční aktivity genů spojených s pluripotencí a diferenciací myších embryonálních kmenových buněk. Plánované zobrazení transkripce v kmenových buňkách se nepodařilo, ale byly získané hodnotné výsledky ohledně pulzace transkripce a byla zavedena nová metoda single molecule RNA FISH. Výsledkem je 5 článků v impaktovaných časopisech a 1 kapitola v odborné knize.

Zahájení řešení

1. 1. 2012

Ukončení řešení

31. 12. 2015

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

26. 3. 2015

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP16-GA0-GA-U/01:1

Datum dodání záznamu

25. 9. 2017

Celkové uznané náklady

7 544 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

7 544 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč