Mechanismy transkripčního pulzování

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Standardní projekty

Veřejná soutěž

Standardní projekty 20 (SGA0201600001)

Hlavní účastníci

Univerzita Karlova / Přírodovědecká fakulta

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

16-12611S

Název projektu anglicky

Mechanisms of transcriptional pulsing

Anotace anglicky

Live cell imaging revealed that high transcriptional activity often alternates with periods of prolonged transcriptional silence. This phenomenon, referred to as transcriptional pulsing, is currently attracting considerable interest. However, the molecular mechanisms that are responsible for the pulsatile nature of gene activity remain to be identified. Here we propose to investigate the influence of cis-acting regulatory sequences on transcriptional dynamics in living mammalian cells. A cell line expressing transgenic nascent transcripts that can be detected by a PP7-GFP reporter will be generated. Site-specific recombination will be used to obtain a collection of subclones that differ only in the enhancer sequences that drive expression of the transgene. Sequences that modulate pulsing parameters will be identified based on quantitative analysis of imaging data and further validated through knockdown of their cognate binding factors. Realization of this project is expected to shed light on a new aspect of gene regulation.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

EB - Genetika a molekulární biologie

CEP - vedlejší obor

—

CEP - další vedlejší obor

—

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics

Hodnocení poskytovatelem

U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Projekt poskytl vhled do stochastického procesu genové regulace (pulzování transkripce) na úrovni jednotlivých buněk v průběhu buněčného cyklu. Výstupem jsou dvě publikace v časopisech s IF. Nebyly shledány nedostatky v dodržování grantových pravidel.

Zahájení řešení

1. 1. 2016

Ukončení řešení

31. 12. 2017

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

5. 4. 2017

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP18-GA0-GA-U/02:1

Datum dodání záznamu

4. 5. 2018

Celkové uznané náklady

3 289 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

3 289 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč