Srovnávací analýza pohlavních chromozomů rostlin

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Standardní projekty

Veřejná soutěž

Standardní projekty 13 (SGA02010GA-ST)

Hlavní účastníci

—

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

P501-10-0102

Název projektu anglicky

Comparative Analysis of Plant Sex Chromosomes

Anotace anglicky

Plant sex chromosomes are rarely heteromorphic and they seem to be evolutionary younger compared to most animal species. So when studying the structure and evolution of plant sex chromosomes we can analyse the first steps in evolution of human sex chromosomes. We have already characterised the sex chromosomes of Silene latifolia and well documented that the Y accumulates many types of repetitive sequences. There are two Y chromosomes in males of Rumex acetosa and appear to be heterochromatic and probably of an older evolutionary age. In this project we want to globally characterise the sorrel genome using the 454-sequencing strategy, and using BAC library and laser microdissection we will isolate some X-linked genes and look for their Y-alleles. The aim of this work is to functionally analyse  X- and Y-linked genes in both experimental plant models (campion and sorrel) in order to demonstrate (a) a different extent of degeneration of the Y chromosome(s), (b) to compare gene expression in different sexes, and (c) to indicate a hypothetical dosage compensation system.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

EB - Genetika a molekulární biologie

CEP - vedlejší obor

GE - Šlechtění rostlin

CEP - další vedlejší obor

EF - Botanika

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>10611 - Plant sciences, botany<br>10612 - Mycology<br>30101 - Human genetics<br>40105 - Horticulture, viticulture<br>40106 - Agronomy, plant breeding and plant protection; (Agricultural biotechnology to be 4.4)

Hodnocení poskytovatelem

V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Projekt mimořádně přispěl k základnímu výzkumu rostlin studiem komplexních aspektů organizace sex chromozómů u S. lativolia a R. acetosa jako dimofismus, zjištění plastidové DNA v chromozómu Y, absence retroelementů na Y chromozómu jako epigenetická ada?

Zahájení řešení

1. 1. 2010

Ukončení řešení

31. 12. 2014

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

19. 3. 2014

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP15-GA0-GA-U/01:1

Datum dodání záznamu

22. 5. 2015

Celkové uznané náklady

5 962 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

5 962 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč