Analýza mikrobiálních komunit z různých vodních prostředí: specifická transkriptomika ve vztahu k znečištění způsobenému těkavými organickými látkami

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Standardní projekty

Veřejná soutěž

Standardní projekty 13 (SGA02010GA-ST)

Hlavní účastníci

—

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

P504-10-0137

Název projektu anglicky

Analysis of microbial communities from different aquatic habitats: specific transcriptomics in relation to pollution by volatile organic compounds

Anotace anglicky

The project aims for a deeper understanding of the relationship between pollution by volatile organic compounds (VOCs) and the activity and biodiversity of microbial genes involved in biodegradation of halogenated VOCs and epoxides. This microbial ecology project links specific environmental transcriptomics of a microbial community with the VOC concentration level of a specific habitat. Contaminated and non-contaminated microbial habitats will be investigated for the presence of selected VOCs, and theseresults will be correlated with the analysis of microbial gene transcripts encoding haloalkane dehalogenases (HADs) and epoxide hydrolases (EHs), which are key enzymes in the biodegradation of halogenated VOCs and epoxides. The entire microbial community of such an investigated site will be analysed by the transcription level and diversity of genes encoding HADs and EHs, and 16S rRNA sequence determination. Our study will retrieve entire specific pro- and eukaryotic genes actively involved in biodegradation of halogenated VOCs and epoxides of a total environmental microbial community.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

EH - Ekologie – společenstva

CEP - vedlejší obor

—

CEP - další vedlejší obor

—

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10618 - Ecology<br>10619 - Biodiversity conservation

Hodnocení poskytovatelem

U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Projekt se zabýval strukturou a funkcí přírodního bakteriálního společenstva na kontaminovaných. Byly částečně analyzovány kontaminující látky, pomocí moderních molekulárně biologických metod byly analyzovány přítomné miroorganismy a sekvence produkovan?

Zahájení řešení

1. 1. 2010

Ukončení řešení

31. 12. 2012

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

1. 4. 2012

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP13-GA0-GA-U/02:3

Datum dodání záznamu

17. 5. 2016

Celkové uznané náklady

2 289 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

2 289 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč