Fylogenetické vztahy v rámci čeledi Bovidae definované na základě analýzy karyotypu a podčeleďově specifických satelitních DNA

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Standardní projekty

Veřejná soutěž

Standardní projekty 13 (SGA02010GA-ST)

Hlavní účastníci

—

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

P506-10-0421

Název projektu anglicky

Phylogenetic relationships in the family Bovidae studied by analysis of subfamily specific DNA repeats and karyotype

Anotace anglicky

Repetitive DNA sequences in both (peri)-centromeric and genome heterochromatin in general represent rapidly evolving genome components, and have been used as efficient phylogenetic markers in several studies so far. In the proposed grant project, evolutionary and phylogenetic relationships of the wide and diverse family Bovidae will be studied by analysis of subfamily specific DNA repeats. Karyotypes of all investigated species will be determined and verified by comparative FISH using bovine painting probes. Subfamily specific DNA repeats isolated from sex chromosomes and centromeres of autosomes will be obtained by the techniques of laser microdissection, DOP-PCR, cloning, inversion PCR, and sequencing. On the basis of the karyotype analysis, and comparison of homologies and interspecific hybridizations (FISH) of examined sequences within the various subfamilies, phylogenetic associations between the investigated species and evolution of sex chromosomes will be specified.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

EB - Genetika a molekulární biologie

CEP - vedlejší obor

EG - Zoologie

CEP - další vedlejší obor

—

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>10613 - Zoology<br>10614 - Behavioral sciences biology<br>10615 - Ornithology<br>10616 - Entomology<br>30101 - Human genetics

Hodnocení poskytovatelem

V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

V souladu s návrhem byla studována evoluce karyotypu (vč. evoluce pohlavních chromosomů) v rámci čel. Bovidae s použitím technik FISH a chromosomal painting. Publikována nová karyotypová data o nedomestikovaných druzích čel. Bovidae. Zhodnocena role mez?

Zahájení řešení

1. 1. 2010

Ukončení řešení

31. 12. 2013

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

7. 6. 2013

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP14-GA0-GA-U/01:1

Datum dodání záznamu

1. 7. 2014

Celkové uznané náklady

4 059 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

3 634 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč