Využití molekulární cytogenetiky v evolučních a taxonomických studiích u Cervidae
Cíle projektu
Čeleď Cervidae (jelenovití) sdružuje druhy s rostoucím ekonomickým potenciálem a ohrožené druhy. Karyotypy a fylogenetická pozice řady druhů jelenovitých jsou dosud nejasné kvůli nedostatku detailních vědeckých informací. Rozsáhlá variabilita počtu (2n=6-70) a struktury chromosomů činí tuto čeleď vhodnou pro studium evoluce založené na mezidruhových molekulárně cytogenetických srovnáních. V tomto projektu plánujeme provést komparativní analýzu širokého spektra druhů, zaměřenou především na málo prostudované druhy, včetně rodu Mazama a jeho cytotypů. Budou stanoveny karyotypové rozdíly a jejich vliv na produkci aneuploidních spermií a reprodukční izolaci, identifikovány intrachromosomové přestavby chromosomu X a srovnány sekvence a chromosomální pozice satelitních DNA u různých druhů Jelenovitých. Za tímto účelem budou v laboratoři VUVeL připraveny FISH sondy pro celé chromosomy a jejich části, BAC a satelitní sondy. Získaná data budou využita ke zpřesnění taxonomické klasifikace a přehodnocení fylogenetických vztahů v rámci Cervidae.
Klíčová slova
CervidaeMazamacomparative cytogeneticskaryotypesatellite DNAX chromosomespermatozoaFISH
Veřejná podpora
Poskytovatel
Grantová agentura České republiky
Program
Mezinárodní projekty
Veřejná soutěž
SGA0202000003
Hlavní účastníci
Výzkumný ústav veterinárního lékařství, v.v.i.
Druh soutěže
VS - Veřejná soutěž
Číslo smlouvy
20-22517J
Alternativní jazyk
Název projektu anglicky
The use of molecular cytogenetics for evolutionary and taxonomic studies among Cervidae
Anotace anglicky
The family Cervidae groups together species with a growing economic potential and endangered species. Karyotypes and phylogenetic position of many deer species are uncertain due to the lack of detailed scientific data. The extensive variation in chromosome numbers (2n=6-70) and structure makes this family suited for evolutionary studies based on interspecies molecular cytogenetic comparisons. In this project, we will perform a comparative analysis in a wide range of deer species, focusing on species lacking comprehensive data, including the genus Mazama and its cytotypes. We will determine karyotype differences and their impact on production of aneuploid spermatozoa and reproductive isolation, identify intrachromosomal rearrangements of the X chromosomes, and compare sequence similarities and chromosomal positions of satellite DNAs in various deer species. For this purpose, whole chromosome, BAC and satellite DNA probes for FISH will be constructed in VRI laboratory. Obtained data will be used to improve taxonomic classification, and review phylogenetic relationships within Cervidae.
Vědní obory
Kategorie VaV
ZV - Základní výzkum
OECD FORD - hlavní obor
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
OECD FORD - vedlejší obor
—
OECD FORD - další vedlejší obor
—
CEP - odpovídající obory
(dle převodníku)EB - Genetika a molekulární biologie
Hodnocení dokončeného projektu
Hodnocení poskytovatelem
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Zhodnocení výsledků projektu
Mezi významné výsledky projektu patří stanovení homologie mezi chromozomy bovidů a jelenů, popis nového druhu jelena, což je významné z hlediska zachování biodiverzity.
Termíny řešení
Zahájení řešení
1. 5. 2020
Ukončení řešení
31. 12. 2021
Poslední stav řešení
U - Ukončený projekt
Poslední uvolnění podpory
30. 4. 2021
Dodání dat do CEP
Důvěrnost údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Systémové označení dodávky dat
CEP22-GA0-GC-U
Datum dodání záznamu
29. 6. 2022
Finance
Celkové uznané náklady
4 215 tis. Kč
Výše podpory ze státního rozpočtu
4 215 tis. Kč
Ostatní veřejné zdroje financování
0 tis. Kč
Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.
0 tis. Kč
Základní informace
Uznané náklady
4 215 tis. Kč
Statní podpora
4 215 tis. Kč
100%
Poskytovatel
Grantová agentura České republiky
OECD FORD
Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
Doba řešení
01. 05. 2020 - 31. 12. 2021