Pospiviroidní patogeneze jako regulační porucha zprostředkovaná malými viroid-specifickými RNA.

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Mezinárodní projekty

Veřejná soutěž

Mezinárodní projekty 4 (SGA02010GA1GC)

Hlavní účastníci

—

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

P501/10/J018

Název projektu anglicky

Pospiviroid pathogenesis as ?regulatory disorder? mediated by viroid-specific small RNAs.

Anotace anglicky

   We will analyze mechanisms of pathogenesis of two viroids (small, infectious, single-stranded, circular, non-coding and autonomously replicating RNAs) from Pospiviroidae family: potato spindle tuber viroid (PSTVd) infecting various crops, vegetables and ornamentals and highly expansive hop stunt viroid (HSVd) that, in particular, represents a danger to hops in Europe. Based on our previous study, we aim to verify the hypothesis that pathogenesis caused by pospiviroids involve viroid-specific (vs) small RNAs, mis-regulation of host-encoded microRNAs and plant transcription factors (TFs). To analyze the mechanism(s) of viroid pathogenesis we perform: 1. ?deep? sequencing of small RNAs; 2. prediction of vsRNA targets in silico including the whole genome data of  PSTVd-sensitive tomato recently available; 3. verification of vsRNA molecular targets, components of silencing mechanisms and TFs involved in pospiviroid pathogenesis by quantitative RNA expression assays, promoter activity assays and by virus-induced gene silencing technology (VIGS) using N. benthamiana, tomato and hop.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

EB - Genetika a molekulární biologie

CEP - vedlejší obor

GF - Choroby, škůdci, plevely a ochrana rostlin

CEP - další vedlejší obor

ED - Fyziologie

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics<br>30105 - Physiology (including cytology)<br>40106 - Agronomy, plant breeding and plant protection; (Agricultural biotechnology to be 4.4)

Hodnocení poskytovatelem

U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Závěrečná zpráva je pečlivě vypracována a obsahuje všechny náležitosti. Projekt byl řešen na výborné úrovni a byly získány původní poznatky o patogenním účinku viroidů a byla potvrzena hypotéza o mnohočetném cílení molekul, které vede k poruchám regulač?

Zahájení řešení

1. 1. 2010

Ukončení řešení

31. 12. 2012

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

30. 3. 2012

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP13-GA0-GC-U/01:2

Datum dodání záznamu

27. 1. 2014

Celkové uznané náklady

3 116 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

3 116 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč