Mechanismus propagace a eliminace parazitické RNA u samčí zárodečné linie při studiu u hospodářsky významného druhu viroidu.

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Mezinárodní projekty

Veřejná soutěž

Mezinárodní projekty 13 (SGA0201800003)

Hlavní účastníci

Ústav experimentální botaniky AV ČR, v. v. i.

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

18-10515J

Název projektu anglicky

Mechanisms of parasitic RNA propagation and elimination in male germline studied on economically important viroid species.

Anotace anglicky

The haploid male germline of higher plants plays a vital role in plant fertility and crop production through the generation and transport of male gametes, double fertilization, seed production and finally through effective mechanisms of the elimination of parasitic nucleic acids from pollen. Some viroids, parasitic single-stranded circular RNAs, adapted to escape such silencing mechanism can be either pollen-transmissible (spread via pollen) or eliminated from developing pollen, depending on plant-pathogen combinations. There is currently no information about molecular interaction of viroids within pollen but it can be assumed that viroid RNA interacts specifically with the metabolism of developing male gametophyte involving small RNAs. Here we will use hop isolate of apple fruit crinkle viroid infection of Nicotiana tabacum as a pollen research model to analyze transcriptomic, degradomic and proteomic data for the identification of mechanism(s) suppressing viroid propagation and leading to viroid elimination at defined check points during male germline development.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

OECD FORD - hlavní obor

10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)

OECD FORD - vedlejší obor

—

OECD FORD - další vedlejší obor

—

CEP - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

EB - Genetika a molekulární biologie

Hodnocení poskytovatelem

U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Cíle projektu byly splněny. Dosažené výsledky přispěly k objasnění mechanismů eliminace parazitické RNA viroidů ze samčí zárodečné linie. Byla potvrzena klíčová role TFIIIA jako faktoru využívaného parazitickou RNA k adaptaci na metabolismus hostitele. Byla ukázána úloha degradomu v tomto procesu. Nebyly zjištěny žádné významné nedostatky v dodržování pravidel nebo využití prostředků.

Zahájení řešení

15. 4. 2018

Ukončení řešení

31. 12. 2021

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

1. 4. 2021

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP22-GA0-GC-U

Datum dodání záznamu

29. 6. 2022

Celkové uznané náklady

11 036 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

10 556 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

480 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč