Struktura, biologie a medicínský potenciál ultra-krátké mimobuněčné DNA v krevní plasmě

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Mezinárodní grantové projekty hodnocené na principu LEAD Agency

Veřejná soutěž

—

Hlavní účastníci

Masarykova univerzita / Středoevropský technologický institut

Druh soutěže

M2 - Mezinárodní spolupráce

Číslo smlouvy

22-04242L

Název projektu anglicky

Structure, biology and medical potential of blood plasma-derived ultra-short cell-free DNA

Anotace anglicky

Fragments of DNA are constantly being released into the human blood circulation following cell death and by active secretion. The fragmentation of cell-free DNA (cfDNA) in blood plasma reflects its tissue of origin and mechanisms of release into the circulation. We established a novel method that enabled us to capture single-stranded ultra-short cfDNA (US cfDNA, ~50 nt) from blood plasma. We found that US cfDNA has its origin upstream of accessible transcription start sites. We observed that these sites are only enriched in US cfDNA when they contain the potential to adopt G-quadruplex and/or i-motif structures. Importantly, our data revealed that the US cfDNA fragments in healthy individuals are significantly more enriched in G4 sequences relative to cfDNA in cancer patients suggesting that US cfDNA have a specific role in cancer physiology. Although relationships of US cfDNA to disease is unknown, exploring alternative structural arrangements contained in ssDNA could improve our understanding of cfDNA biology leading to further opportunities to develop novel diagnostic strategies.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

OECD FORD - hlavní obor

30204 - Oncology

OECD FORD - vedlejší obor

30205 - Hematology

OECD FORD - další vedlejší obor

—

CEP - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

FD - Onkologie a hematologie

Zahájení řešení

1. 10. 2022

Ukončení řešení

31. 12. 2025

Poslední stav řešení

K - Končící víceletý projekt

Poslední uvolnění podpory

3. 7. 2024

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP25-GA0-GF-R

Datum dodání záznamu

14. 3. 2025

Celkové uznané náklady

10 272 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

9 732 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

540 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč