Parentálně specifická epigenetická regulace mezigeneračního šíření retrotranspozonů u rostlin

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Juniorské granty

Veřejná soutěž

Juniorské granty 1 (SGA0201500002)

Hlavní účastníci

Biofyzikální ústav AV ČR, v. v. i.

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

15-21523Y

Název projektu anglicky

Parent-specific epigenetic regulation of transgenerational retrotransposon proliferation in plants

Anotace anglicky

Currently, little is known, whether transgenerational proliferation of transposable elements (TEs) is influenced differentially in paternal and maternal germlines of plants. Since some TEs differ in production of 24-nt sRNAs and show extraordinary variance in abundance along plant sex chromosomes, we have proposed that absence of some TEs on a Y chromosome might be caused by an individualized RNAi-based silencing acting during gamete formation and embryogenesis. To examine this issue, we will study transgenerational proliferation of selected LTR retrotransposons in the dioecious plant Silene latifolia possessing heteromorphic sex chromosomes. Transgenic line carrying modified TE will be crossed with wild type plants and individuals of the F1 generation will be analyzed for new insertions. We will also study the effect of selected genes involved in RNA-directed DNA methylation (RdDM) pathway using mutant lines and massive parallel sequencing of transcriptome and methylome.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

EB - Genetika a molekulární biologie

CEP - vedlejší obor

—

CEP - další vedlejší obor

—

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics

Hodnocení poskytovatelem

U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Řešení projektu, jehož evaluace byla na žádost řešitele o rok odložena, významně přispělo k poznání molekulárních mechanismů parentálně specifické regulace mezigeneračního přenosu retrotranspozonů u rostlin. Byla získána řada originálních výsledků, z nichž většina byla zveřejněna - v kvalitních impaktovaných časopisech vyšly čtyři práce (jeden původní a tři přehledné články) s dedikací na projekt.

Zahájení řešení

1. 1. 2015

Ukončení řešení

25. 4. 2019

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

17. 3. 2017

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP20-GA0-GJ-U/01:1

Datum dodání záznamu

2. 7. 2020

Celkové uznané náklady

5 298 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

5 298 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč