Molekulární stavba protein-DNA komplexů zapojených v opravě nukleotidových sestřihů

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Juniorské granty

Veřejná soutěž

Juniorské granty 1 (SGA0201500002)

Hlavní účastníci

Masarykova univerzita / Středoevropský technologický institut

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

15-22380Y

Název projektu anglicky

Molecular architecture of protein-DNA complexes involved in Nucleotide Excision Repair

Anotace anglicky

The present research combines biochemical and structural tools to study protein-DNA complexes that coordinate the 5′-incision step during Nucleotide Excision Repair (NER). We aim to fully comprehend DNA junction recognition and catalytic function of XPF/ERCC1 heterodimer, and address the critical role of XPA in carcinogen damage recognition and modulation of XPF/ERCC1 activity. To address these objectives, we will utilize a multidisciplinary approach that comprises the latest advances of solution NMR Spectroscopy, critical information from Small Angle Scattering, and innovative modelling approaches. Our studies will offer novel mechanistic insight for a major defense system against UV light and carcinogens with importance to human health. Our findings will assist to make connections among recessive mutations, functions and disease, and offer new means to modulate NER function in the future for therapeutic purposes.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

CE - Biochemie

CEP - vedlejší obor

BO - Biofyzika

CEP - další vedlejší obor

—

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>10610 - Biophysics

Hodnocení poskytovatelem

V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Byla provedena funkční charakterizace heterodimeru XPF/ERCC1 a získán NMR strukturní model. Strukturní data společně s mapováním DNA vázajících povrchů dávají mechanistické vysvětlení pro DNA opravný mechanismus. Byla vyvinuta nová metodologie 4D-CHAINS, která zvýší rychlost zpracování NMR dat. Výstupem projektu jsou tři vynikající publikace, dvě z nich s IF>10.

Zahájení řešení

1. 1. 2015

Ukončení řešení

31. 12. 2017

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

5. 4. 2017

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP18-GA0-GJ-U/02:1

Datum dodání záznamu

4. 5. 2018

Celkové uznané náklady

7 763 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

7 763 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč