Vývoj spolehlivých metod pro automatizovanou kvantitativní charakterizaci buněčné motility ve fluorescenční mikroskopii

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Juniorské granty

Veřejná soutěž

Juniorské granty 2 (SGA0201600002)

Hlavní účastníci

Masarykova univerzita / Fakulta informatiky

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

16-03909Y

Název projektu anglicky

Development of Reliable Methods for Automated Quantitative Characterization of Cell Motility in Fluorescence Microscopy

Anotace anglicky

Biomedical research oriented toward understanding the mechanisms of cell motility and its regulation in tumor cells generates, using fully automated optical microscopes, massive amounts of multidimensional image data, making manual analyses extremely laborious and highly error-prone. Therefore, there is a natural demand for reliable image analysis methods to automatically quantify the acquired image data. In this project, we want to focus on the development of reliable image analysis methods for quantitative characterization of cell motility driven by cellular protrusions at the leading edge of crawling cells. The developed methods will be verified and their limits and parameter sensitivity will be studied on time-lapse, three-dimensional fluorescence microscopy images as well as on synthetic images, which realistically mimic motile cells with cellular protrusions, covering a wide range of imaging and biomechanical conditions. This project will provide informatics tools for better understanding of complex behavior of motile cells in biological processes such as tumorigenesis.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

IN - Informatika

CEP - vedlejší obor

—

CEP - další vedlejší obor

—

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10201 - Computer sciences, information science, bioinformathics (hardware development to be 2.2, social aspect to be 5.8)

Hodnocení poskytovatelem

U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Cílem projektu byl výzkum v oblasti spolehlivých metod analýzy obrazu pro kvantitativní charakterizaci buněčné motility s využitím fluorescenční mikroskopie a simulací. Byly realizované původní výsledky, které korespondují s cíli projektu. Výsledky byly publikovány ve dvou impaktovaných časopisech s přispěním zahraniční spolupráce a prezentovány na 4 konferencích. Cíle projektu byly splněny.

Zahájení řešení

1. 1. 2016

Ukončení řešení

31. 12. 2018

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

16. 4. 2018

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP19-GA0-GJ-U/01:2

Datum dodání záznamu

11. 6. 2019

Celkové uznané náklady

5 884 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

5 884 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč