Chromatin asociované faktory podílející se na regulaci 45SrDNA v Arabidopsis

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Juniorské granty

Veřejná soutěž

Juniorské granty 2 (SGA0201600002)

Hlavní účastníci

Masarykova univerzita / Středoevropský technologický institut

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

16-04166Y

Název projektu anglicky

Chromatin associated factors involved in regulation of Arabidopsis 45SrDNA

Anotace anglicky

Arabidopsis 45S rDNA is located on chromosome 2 and 4. There are at least 4 45SrDNA variants, expressed differenly during plant development. Stability of 45SrDNA is disrupted in fas mutants (mutants in chromatin assembly factor CAF1), where the 45SrDNA copy number systematically decreases. As shown in our preliminary data, this phenomenon is not fully reversible, even if plants are propagated for several generations in WT background. Aside 45SrDNA loss, expression of DNA damage proteins is stimulated in fas mutants. Also epigenetic factors or proteins involved in homologous recombination were shown to contribute to the 45SrDNA maintenance and here we plan to expand the knowledge in this field even further. We will look at epigenetic changes associated to recovery from fas background, analyse other histone chaperones and DNA damage kinases to determine their contribution in 45SrDNA maintenance as well as determine the presence of H3 histone variants in 45SrDNA locus.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

EB - Genetika a molekulární biologie

CEP - vedlejší obor

—

CEP - další vedlejší obor

—

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics

Hodnocení poskytovatelem

V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Projekt výrazně přispěl k objasnění faktorů, které se podílí na udržení 45S rDNA u Arabidopsis Thaliana, včetně epigenetických změn spojených s obnovením genomu u rostlin po mutaci genů pro chromatin assembly faktoru CAF1. Během 3let řešení tohoto juniorského projektu byly publikovány 4 práce ve velmi kvalitních časopisech, další rukopis je ve finální fázi recenzního řízení.

Zahájení řešení

1. 1. 2016

Ukončení řešení

31. 12. 2018

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

16. 4. 2018

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP19-GA0-GJ-U/01:2

Datum dodání záznamu

11. 6. 2019

Celkové uznané náklady

6 880 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

6 880 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč