Struktura a dynamika 45S rDNA lokusů v Arabidopsis thaliana

Poskytovatel

Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy

Program

KONTAKT II

Veřejná soutěž

KONTAKT II 5 (SMSM2015LH5)

Hlavní účastníci

Masarykova univerzita / Středoevropský technologický institut

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

MSMT-32267/2015-1

Název projektu anglicky

Structure and dynamics of 45S rDNA loci in Arabidopsis thaliana

Anotace anglicky

The project aims: i) to describe the structure of both 45S rDNA chromosome loci, including the arrangement of active and inactive 45S rDNA variants, and to analyze proximal and distal borders of the 45S rDNA loci; ii) to find out whether in fas mutants, a preferential loss occurs in either of the 45S rDNA loci, and what happens with the other locus under these conditions. In revertants, which accumulate rDNA copies, potential non-equivalence of the loci will also be investigated; iii) to identify genetic and epigenetic factors determining a differential expression and replication timing of 45S rDNA variants. As its strategic goal, the project aims to strengthen and deepen the research collaboration with a top-class team in the USA, thereby increasing our competence and competitiveness in this field of basic research.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

EB - Genetika a molekulární biologie

CEP - vedlejší obor

—

CEP - další vedlejší obor

—

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics

Hodnocení poskytovatelem

V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Bylo objasněno uspořádání a sekvenční variabilita aktivních a umlčených variant 45S rDNA. U rostlin s vyřazenou funkcí CAF-1 byl charakterizován průběh ztráty variant rDNA a jejich zpětné akumulace po obnovení funkce CAF-1. Byly popsány genetické a epigenetické faktory diferenciální exprese a replikace variant rDNA. Byl získán prostoročasový obraz replikace aktivní rDNA s vysokým rozlišením, očištěný od obrazu replikace neaktivní rDNA. Výsledky byly publikovány formou 6 publikací, 5 konferenčních sdělení, 1 disertační a 1 diplomové práce.

Zahájení řešení

1. 11. 2015

Ukončení řešení

31. 12. 2017

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

2. 3. 2017

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP18-MSM-LH-U/01:1

Datum dodání záznamu

7. 6. 2018

Celkové uznané náklady

1 972 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

1 972 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč