Ztráta specifických repetic DNA v důsledku dysfunkce CAF1 u rostlin

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Standardní projekty

Veřejná soutěž

Standardní projekty 14 (SGA02011GA-ST)

Hlavní účastníci

Masarykova univerzita / Středoevropský technologický institut

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

P501-11-0289

Název projektu anglicky

Loss of specific DNA repeats in response to dysfunction of CAF1 in plants

Anotace anglicky

Chromatin assembly factor 1 (CAF1) is a three-subunit histone chaperone depositing histones H3/H4 onto replicating DNA. Arabidopsis CAF1 mutants show abnormal morphology, changes in gene silencing and increased homol. recombination. Our pilot study shows that dysfunction of CAF1 results in telomere shortening and severe loss of 45S rDNA, without affecting the other Arabidopsis DNA repeats. Using genetic and biochemical approaches, we will test our hypothesis that the observed loss of telomeres and 45S rDNA results from incomplete replication (due to replication stalling in these loci) and subsequent repair events. Involvement of other mechanisms (e.g., telomerase insufficiency, transcription/replication collisions) will also be considered. Causative role of CAF1 mutations will be tested by backcrossing and complementation experiments to induce a possible reversal of the genomic changes. The project thus aims to elucidate interplay between genetic and epigenetic processes (chromatin assembly, DNA replication, repair and recombination, telomere maintenance) in genome stability control.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

EB - Genetika a molekulární biologie

CEP - vedlejší obor

—

CEP - další vedlejší obor

—

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics

Hodnocení poskytovatelem

V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Řešení projektu přineslo detailní popis nového typu genetické nestability způsobené vyřazením fas genů. Byly zjištěny souvislosti mezi danými mutacemi a progresivní ztrátou telomer a 45S rDNA repetic. Mechanizmem způsobujícím ztráty je nehomologní rekombinace. Výstupem projektu je 6 publikací v prestižních časopisech. Projekt je hodnocen jako vynikající.

Zahájení řešení

1. 1. 2011

Ukončení řešení

31. 12. 2015

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

20. 4. 2015

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP16-GA0-GA-U/01:1

Datum dodání záznamu

25. 9. 2017

Celkové uznané náklady

8 686 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

8 686 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč