Molekulární struktura a evoluce lokusu 45S rDNA banánovníku (Musa spp.)

Poskytovatel

Akademie věd České republiky

Program

Granty výrazně badatelského charakteru zaměřené na oblast výzkumu rozvíjeného v současné době zejména v AV ČR

Veřejná soutěž

Výzkumné granty 7 (SAV02007-A)

Hlavní účastníci

—

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

IAA600380703

Název projektu anglicky

Molecular organization and evolution of the 45S rDNA locus in banana (Musa spp.)

Anotace anglicky

We propose to analyze molecular organization of the 45S rDNA (ribosomal DNA) locus in banana (Musa spp.). For the first time, a complete nucleotide sequence of the 45S rDNA cluster in banana will be obtained and used to analyze insertion of repetitive DNA sequences within the rDNA array. rDNA locus from a triploid Musa clone with amplified NOR will serve as a model to analyze the mode of rDNA locus expansion. DNA markers will be developed from intergenic spacer (IGS) and their suitability for phylogenetic analyses will be tested on a set of Musa species and clones. Novel data that will be obtained will shed light on the evolution of this dynamic genomic region and lead to a better understanding of the structure and evolution of the Musa genome. They will also provide insights useful for the assembly of the nucleotide sequence of the entire nuclear genome.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

EF - Botanika

CEP - vedlejší obor

GE - Šlechtění rostlin

CEP - další vedlejší obor

EI - Biotechnologie a bionika

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10611 - Plant sciences, botany<br>10612 - Mycology<br>20801 - Environmental biotechnology<br>20802 - Bioremediation, diagnostic biotechnologies (DNA chips and biosensing devices) in environmental management<br>20803 - Environmental biotechnology related ethics<br>20901 - Industrial biotechnology<br>20902 - Bioprocessing technologies (industrial processes relying on biological agents to drive the process) biocatalysis, fermentation<br>20903 - Bioproducts (products that are manufactured using biological material as feedstock) biomaterials, bioplastics, biofuels, bioderived bulk and fine chemicals, bio-derived novel materials<br>30401 - Health-related biotechnology<br>30402 - Technologies involving the manipulation of cells, tissues, organs or the whole organism (assisted reproduction)<br>30403 - Technologies involving identifying the functioning of DNA, proteins and enzymes and how they influence the onset of disease and maintenance of well-being (gene-based diagnostics and therapeutic interventions [pharmacogenomics, gene-based therapeutics])<br>30404 - Biomaterials (as related to medical implants, devices, sensors)<br>30405 - Medical biotechnology related ethics<br>40105 - Horticulture, viticulture<br>40106 - Agronomy, plant breeding and plant protection; (Agricultural biotechnology to be 4.4)<br>40401 - Agricultural biotechnology and food biotechnology<br>40402 - GM technology (crops and livestock), livestock cloning, marker assisted selection, diagnostics (DNA chips and biosensing devices for the early/accurate detection of diseases) biomass feedstock production technologies, biopharming<br>40403 - Agricultural biotechnology related ethics

Hodnocení poskytovatelem

V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Byla popsána struktura 45S rDNA v čeledi Musaceae. Fylogenetická rekonstrukce s využitím ITS sekvencí ukázala, že rod Musa je rozdělen na dva klady. Díky neúplné evoluci v koncertu je možné využít sekvence ITS pro určení genomového složení hybridů.

Zahájení řešení

1. 1. 2007

Ukončení řešení

31. 12. 2010

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

9. 3. 2010

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP11-AV0-IA-U/02:2

Datum dodání záznamu

28. 6. 2013

Celkové uznané náklady

3 519 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

3 519 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč