Evoluce sekvenčního a strukturního prostoru terestriálních bílkovin
Veřejná podpora
Poskytovatel
Grantová agentura České republiky
Program
Juniorské granty
Veřejná soutěž
Juniorské granty 3 (SGA0201700002)
Hlavní účastníci
Univerzita Karlova / Přírodovědecká fakulta
Druh soutěže
VS - Veřejná soutěž
Číslo smlouvy
17-10438Y
Alternativní jazyk
Název projektu anglicky
Terrestrial protein sequence and structure space evolution
Anotace anglicky
By the time of the Last Universal Common Ancestor (LUCA), life had evolved to build proteins using a standard alphabet of 20 amino acids. Its contents define what protein structures/functions can be constructed. Diverse lines of evidence converge to indicate that earlier life built proteins using a smaller alphabet, and that other amino acids were available for use. Here we propose a broad study of the relationship between the evolution of the amino acid alphabet, and the consequent repertoire of protein structures. Two parallel approaches will be employed: (i) analysis of secondary structure motif formation within vast libraries of randomly generated protein sequences, and (ii) use of contemporary proteins in “reverse evolution” experiments to assess the integrity of protein structure/function with the early amino acid alphabet. A better understanding of the protein folds accessible to an amino acid alphabet consisting of prebiotically plausible molecules would benefit understanding of life's early evolution, and our expectations for potential evolution of life elsewhere.
Vědní obory
Kategorie VaV
ZV - Základní výzkum
CEP - hlavní obor
CE - Biochemie
CEP - vedlejší obor
BO - Biofyzika
CEP - další vedlejší obor
—
OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)
10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>10610 - Biophysics
Termíny řešení
Zahájení řešení
1. 1. 2017
Ukončení řešení
31. 12. 2021
Poslední stav řešení
—
Poslední uvolnění podpory
10. 4. 2019
Dodání dat do CEP
Důvěrnost údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Systémové označení dodávky dat
CEP21-GA0-GJ-R/02:1
Datum dodání záznamu
22. 2. 2021
Finance
Celkové uznané náklady
8 369 tis. Kč
Výše podpory ze státního rozpočtu
8 369 tis. Kč
Ostatní veřejné zdroje financování
0 tis. Kč
Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.
0 tis. Kč