Struktura a dynamika peptidového tunelu v ribozomu
Veřejná podpora
Poskytovatel
Grantová agentura České republiky
Program
Juniorské granty
Veřejná soutěž
Juniorské granty 5 (SGA0201900002)
Hlavní účastníci
Vysoká škola chemicko-technologická v Praze / Fakulta chemicko-inženýrská
Druh soutěže
VS - Veřejná soutěž
Číslo smlouvy
19-06479Y
Alternativní jazyk
Název projektu anglicky
Structure and dynamics of the ribosome exit tunnel
Anotace anglicky
The ribosome is a huge biomolecular complex, which catalyzes peptide bond formation between amino acids. This way, a vast majority of proteins in living organisms is produced. The catalytic site is buried deep in the large ribosomal subunit. Hence, the newly synthesized protein - the nascent chain - leaves the ribosome through a tunnel. The tunnel walls are made of ribosomal RNA and three ribosomal proteins. The exact role of the proteins remains elusive. However, because parts of the proteins reach the ribosome surface, it is presumed that they allosterically transfer information from the tunnel towards cytosol. The proposed project is focused on the three tunnel proteins. By means of large-scale molecular simulations and database analyses, we will study the allosteric signal and the role of nascent chain in the tunnel-protein dynamics. The main outcome of the project will be the description of these phenomena at atomic level presented in a written form in about 5 peer-reviewed articles, and orally on national and international conferences.
Vědní obory
Kategorie VaV
ZV - Základní výzkum
OECD FORD - hlavní obor
10608 - Biochemistry and molecular biology
OECD FORD - vedlejší obor
—
OECD FORD - další vedlejší obor
—
CEP - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)
CE - Biochemie<br>EB - Genetika a molekulární biologie
Termíny řešení
Zahájení řešení
1. 1. 2019
Ukončení řešení
31. 12. 2023
Poslední stav řešení
—
Poslední uvolnění podpory
12. 5. 2021
Dodání dat do CEP
Důvěrnost údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Systémové označení dodávky dat
CEP22-GA0-GJ-R
Datum dodání záznamu
21. 2. 2022
Finance
Celkové uznané náklady
3 611 tis. Kč
Výše podpory ze státního rozpočtu
3 611 tis. Kč
Ostatní veřejné zdroje financování
0 tis. Kč
Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.
0 tis. Kč