Genomická a geografická diversifikace v průběhu speciace sinic

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Juniorské granty

Veřejná soutěž

Juniorské granty 5 (SGA0201900002)

Hlavní účastníci

Univerzita Palackého v Olomouci / Přírodovědecká fakulta

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

19-12994Y

Název projektu anglicky

Unraveling genomic and geographical diversification during speciation in cyanobacteria

Anotace anglicky

The diversity of organisms inhabiting Earth comprises of billions of species. Majority of them belongs to prokaryotes. However, processes responsible for such incredible diversity are largely unknown. In this project, we plan to investigate speciation processes in world-wide distributed, mat-forming cyanobacterium Microcoleus. We will employ state-of-the art sequencing methods to obtain high quality genomes from populations distributed in Europe and USA to achieve a wide geographical range. We will explore the patterns of structural and nucleotide variation in the genome among diverging lineages on a geographical gradient. It will shed some light on a long-lasting question of the role of geographic isolation in evolution of microorganisms. Subsequently, we will investigate patterns of divergence and gene flow among lineages (populations/species) over the whole genome. This will help us to understand which mechanisms which are driving evolution within the genome on a population/species level. Finally, we will infer history of population size and gene flow between populations.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

OECD FORD - hlavní obor

10602 - Biology (theoretical, mathematical, thermal, cryobiology, biological rhythm), Evolutionary biology

OECD FORD - vedlejší obor

—

OECD FORD - další vedlejší obor

—

CEP - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

EA - Morfologické obory a cytologie

Zahájení řešení

1. 1. 2019

Ukončení řešení

30. 6. 2022

Poslední stav řešení

—

Poslední uvolnění podpory

1. 4. 2022

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP23-GA0-GJ-R

Datum dodání záznamu

26. 6. 2023

Celkové uznané náklady

3 925 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

3 925 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč