Evoluce karyotypu a velikosti genomu v čeledi Cyperaceae

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Standardní projekty

Veřejná soutěž

Standardní projekty 12 (SGA02009GA-ST)

Hlavní účastníci

—

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

206-09-1405

Název projektu anglicky

Genome size and karyotype evolution in Cyperaceae

Anotace anglicky

The main goal of the project is an analysis of patterns of genomic parameters: genome size, chromosome number, chromosome size, genomic AT/GC composition, retrotransposon diversity and widespread in taxa of two contrasting model genera with holokinetic chromosomes: Carex and Eleocharis. Evolutionary dynamics of these species-specific genomic parameters in the framework of the phylogeny based on molecular sequence markers will be used for the evaluation of the role of key mechanisms in genome size evolution: (i) polyploidy; (ii) agmatoploidy, (iii) symploidy, (iv-v) retrotransposon amplification or removal in the main evolutionary lineages of taxa studied. The model is therefore not a concrete species as in classical genomic studies but the group of species connected by the net of their evolutionary relationships. The models are contrasting in (i) species diversity, (ii) evolutionary centres, (iii) ecological diversification, but mainly in (iv) variation ranges of chromosome and genome sizes, which arein Eleocharis ones of the largest known among angiosperms genera.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

EF - Botanika

CEP - vedlejší obor

—

CEP - další vedlejší obor

—

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10611 - Plant sciences, botany<br>10612 - Mycology

Hodnocení poskytovatelem

V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Projekt popsal klíčové mechanismy v evoluci karyotypu a velikosti genomu v rodech Carex a Eleocharis, inovoval algoritmus pro tvorbu fylogenetických stromů a odhalil hlavní fylogenetické trendy odlišující evoluci holocentrických karyotypů od evoluce kar?

Zahájení řešení

1. 1. 2009

Ukončení řešení

31. 12. 2012

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

1. 4. 2012

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP13-GA0-GA-U/02:3

Datum dodání záznamu

17. 5. 2016

Celkové uznané náklady

6 538 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

6 538 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč