Evoluce GC obsahu a genomu trav

Název projektu anglicky
GC content and genome evolution of grasses
Anotace anglicky
The main goal of this project is to survey of variability in GC bases content (guanine and cytosine) related to species phylogeny and global genome evolution. The study will be devoted to model family Poaceae (grasses), typical of highest and most variable GC content within higher plants, and will concern all hierarchical levels, from inter-family, inter-generic, inter-specific, to intra-specific differences. Particular studies are devoted to (i) map the origin and consecutive evolution of high GCcontent of grass genomes and genes within Monocots, (ii) survey variability of GC content and chromosome size among main grass evolutionary lineages, (iii) test evolutionary significance of high GC content and thus higher DNA thermostability for plants from extreme climatic conditions, (iv) prove relation of GC content variability with transposable elements-driven genome expansions and contractions (on inter-specific level in genus Oryza, on intra-specific in Festuca pallens), and (v) to prove possible

Kategorie VaV
ZV - Základní výzkum
CEP - hlavní obor
EF - Botanika
CEP - vedlejší obor
—
CEP - další vedlejší obor
—
OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)
10611 - Plant sciences, botany<br>10612 - Mycology

Hodnocení poskytovatelem
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Zhodnocení výsledků projektu
V průběhu projektu byla naměřena velikost genomu a GC obsah u 770 druhů (72 z 81 čeledí jednoděložných; 350 z toho Poaceae a z nich 90 Oryza). Tento datový soubor je nejrozsáhlejší a fylogeneticky nejrobustnější přehled genomických p?

Důvěrnost údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Systémové označení dodávky dat
CEP11-GA0-GP-U/04:3
Datum dodání záznamu
20. 3. 2015

Podobné projekty(10)