Obři mezi trpaslíky: genomová obezita u brukvovitých

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Standardní projekty

Veřejná soutěž

SGA0202500001

Hlavní účastníci

Masarykova univerzita / Středoevropský technologický institut

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

25-16142S

Název projektu anglicky

The giants among Lilliputians: genome obesity in crucifers

Anotace anglicky

The vast genome size variation in plants is due to the occurrence of giant and Lilliputian nuclear genomes. The largest genome size variation within the mustard family (Brassicaceae) is restricted to the supertribe Hesperodae. Whereas the Hesperodae species are diploid, they exhibit 16-fold genome size variation and 20-fold variation in chromosome size. This genomic variation provides ample opportunity for comparative and evolutionary genomics, but is hampered by a lack of genomic resources. We hypothesize that the genomic differences are primarily caused by the proliferation of transposable elements (TEs) and possibly by genome defenses that suppress TE activity. We intend to analyze and compare giant and small Hesperodae genomes by long-read sequencing, epigenomic and cytogenomic methods to elucidate how differential tolerance to TE proliferation determines the differences in genome and chromosome size, chromosome architecture and 3D chromatin organization among Hesperodae species. Our research will bring the group into the focus of comparative research within the model family.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

OECD FORD - hlavní obor

10611 - Plant sciences, botany

OECD FORD - vedlejší obor

—

OECD FORD - další vedlejší obor

—

CEP - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

EF - Botanika

Zahájení řešení

1. 1. 2025

Ukončení řešení

31. 12. 2027

Poslední stav řešení

Z - Začínající víceletý projekt

Poslední uvolnění podpory

—

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP25-GA0-GA-R

Datum dodání záznamu

1. 3. 2025

Celkové uznané náklady

11 591 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

11 080 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

511 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč