Retenční mechanismus intaktních glykopeptidů v hydrofilní interakční kapalinové chromatografii

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Juniorské granty

Veřejná soutěž

Juniorské granty 5 (SGA0201900002)

Hlavní účastníci

Univerzita Karlova / Přírodovědecká fakulta

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

19-18005Y

Název projektu anglicky

Retention mechanisms of intact glycopeptides in hydrophilic interaction liquid chromatography

Anotace anglicky

We propose to perform a systematic study of retention mechanisms of glycopeptides in hydrophilic interaction liquid chromatography (HILIC). Accordingly, we will described in detail separation systems and key factors affecting HILIC, and will develop a practical guide for selecting suitable conditions for glycopeptide separation by HILIC. Moreover, we will derive a mathematical model for predicting glycopeptide retention time windows to incorporate them into glycoproteomics search engines towards enhancing glycopeptide identification and minimizing false-positives. In the final step, we will use the knowledge gained during this project to optimize the HILIC method in a nanoscale setting to separate isobaric glycopeptides of serum proteins, which are fucosylated either on the glycan core or on the glycan arm. The method will be then applied to clinical samples for studying liver diseases.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

OECD FORD - hlavní obor

10406 - Analytical chemistry

OECD FORD - vedlejší obor

—

OECD FORD - další vedlejší obor

—

CEP - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

CB - Analytická chemie, separace

Hodnocení poskytovatelem

U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Záměry projektu byly naplněny. Odborným přínosem projektu je zejména popis retenčního chování glykopeptidů v LC a model predikce retenčních oken v HILIC. Celkově bylo publikováno 6 kvalitních článků a výsledky prezentovány na mezinárodních konferencích. Projekt byl částečně řešen formou mezinárodní spolupráce a celkem se na něm podílelo velké množství studentů magisterského i doktorského studia.

Zahájení řešení

1. 1. 2019

Ukončení řešení

30. 6. 2022

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

1. 4. 2022

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP23-GA0-GJ-U

Datum dodání záznamu

26. 6. 2023

Celkové uznané náklady

3 402 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

3 402 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč