Heterolobosea jako modelová skupina při studiu role horizontálního genového přenosu v evoluci anaerobních linií eukaryot
Veřejná podpora
Poskytovatel
Grantová agentura České republiky
Program
Juniorské granty
Veřejná soutěž
SGA0202000002
Hlavní účastníci
Univerzita Karlova / Přírodovědecká fakulta
Druh soutěže
VS - Veřejná soutěž
Číslo smlouvy
20-16549Y
Alternativní jazyk
Název projektu anglicky
Heterolobosea as a model group for studying the role of horizontal gene transfer in anaerobic eukaryotic lineages
Anotace anglicky
Horizontal gene transfer (HGT) involves the transfer of genes between unrelated organisms. Recent studies indicate that HGT is an important source of evolutionary novelties in eukaryotes and provides the capacity to adapt to new environments. However, importance of HGT for eukaryotic evolution and evolution of anaerobosis is still subject of heated debate. The proposed project address role and impact of HGT using Heterolobosea, deep-branching eukaryotic group, as a model. The group displays huge genetic and morphological diversity and inhabit wide range of habitats including anoxic sediments, guts of animals, hypersaline brines, and thermal springs. We will analyze transcriptomic and genomic data of strategically sampled heterolobosean lineages to identify prokaryote-to-eukaryote and eukaryote-to-eukaryote HGTs and trace those events using phylogenomic framework. We will estimate number of HGTs in Heterolobosea with special attention to genes involved in anaerobiosis and compare impact of genes acquired by HGT with those present in the common ancestor of Heterolobosea.
Vědní obory
Kategorie VaV
ZV - Základní výzkum
OECD FORD - hlavní obor
10606 - Microbiology
OECD FORD - vedlejší obor
—
OECD FORD - další vedlejší obor
—
CEP - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)
EE - Mikrobiologie, virologie
Termíny řešení
Zahájení řešení
1. 1. 2020
Ukončení řešení
30. 6. 2023
Poslední stav řešení
—
Poslední uvolnění podpory
1. 4. 2023
Dodání dat do CEP
Důvěrnost údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Systémové označení dodávky dat
CEP24-GA0-GJ-R
Datum dodání záznamu
21. 5. 2024
Finance
Celkové uznané náklady
5 355 tis. Kč
Výše podpory ze státního rozpočtu
5 295 tis. Kč
Ostatní veřejné zdroje financování
60 tis. Kč
Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.
0 tis. Kč