Cell*: webová platforma pro vizualizaci, modelování a dynamiku organelových a buněčných struktur

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

JUNIOR STAR

Veřejná soutěž

SGA0202200005

Hlavní účastníci

Masarykova univerzita / Přírodovědecká fakulta

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

22-30571M

Název projektu anglicky

Cell*: a web platform for visualization, modelling and dynamics of organnel- and cell-sized structures

Anotace anglicky

Biomacromolecular structural data is a highly valuable research resource. Reconstruction of whole organelles and cells is the cutting-edge research in this area, but a community strongly lacks services for their efficient visualization and modelling. In this project, we will develop a Cell* web platform, which will solve this gap. Moreover, Cell* will show the structures in the context of experimental data and biological and chemical properties. It will provide an insight into organelle and cell biology through the integration of structural models. Cell* will be a breakthrough solution also due to its capabilities to visualize dynamics of cell-sized structures and perform their animations. In this project, I will use my experience with the development of LiteMol and Mol* web tools for the visualization of large biomacromolecular assemblies and complexes. LiteMol was published in Nature Methods and it was the main viewer in PDBe. LiteMol was replaced by Mol*, which is now a main structure visualization tool in PDBe and RCSB PDB. I have been a lead developer of both LiteMol and Mol*.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

OECD FORD - hlavní obor

10201 - Computer sciences, information science, bioinformathics (hardware development to be 2.2, social aspect to be 5.8)

OECD FORD - vedlejší obor

—

OECD FORD - další vedlejší obor

—

CEP - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

AF - Dokumentace, knihovnictví, práce s informacemi<br>BC - Teorie a systémy řízení<br>BD - Teorie informace<br>IN - Informatika

Zahájení řešení

1. 1. 2022

Ukončení řešení

31. 12. 2026

Poslední stav řešení

B - Běžící víceletý projekt

Poslední uvolnění podpory

9. 5. 2023

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP24-GA0-GM-R

Datum dodání záznamu

19. 2. 2024

Celkové uznané náklady

24 964 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

24 964 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč